Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6A4

CFAP20, Cilia- and flagella-associated protein 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP20Q9Y6A4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP20Q9Y6A4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFAP20Q9Y6A4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFAP20Q9Y6A4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFAP20Q9Y6A4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFAP20Q9Y6A4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP20Q9Y6A4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP20Q9Y6A4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CFAP20Q9Y6A4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CFAP20Q9Y6A4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CFAP20Q9Y6A4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CFAP20Q9Y6A4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CFAP20Q9Y6A4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CFAP20Q9Y6A4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CFAP20Q9Y6A4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CFAP20Q9Y6A4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CFAP20Q9Y6A4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CFAP20Q9Y6A4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CFAP20Q9Y6A4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CFAP20Q9Y6A4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CFAP20Q9Y6A4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CFAP20Q9Y6A4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CFAP20Q9Y6A4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CFAP20Q9Y6A4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CFAP20Q9Y6A4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CFAP20Q9Y6A4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CFAP20Q9Y6A4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CFAP20Q9Y6A4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP20Q9Y6A4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP20Q9Y6A4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP20Q9Y6A4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP20Q9Y6A4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP20Q9Y6A4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP20Q9Y6A4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP20Q9Y6A4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP20Q9Y6A4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP20Q9Y6A4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP20Q9Y6A4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP20Q9Y6A4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP20Q9Y6A4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP20Q9Y6A4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP20Q9Y6A4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP20Q9Y6A4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP20Q9Y6A4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP20Q9Y6A4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP20Q9Y6A4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP20Q9Y6A4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP20Q9Y6A4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP20Q9Y6A4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP20Q9Y6A4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP20Q9Y6A4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP20Q9Y6A4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP20Q9Y6A4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP20Q9Y6A4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP20Q9Y6A4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP20Q9Y6A4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP20Q9Y6A4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP20Q9Y6A4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP20Q9Y6A4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP20Q9Y6A4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP20Q9Y6A4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP20Q9Y6A4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP20Q9Y6A4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP20Q9Y6A4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP20Q9Y6A4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP20Q9Y6A4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP20Q9Y6A4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP20Q9Y6A4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP20Q9Y6A4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP20Q9Y6A4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP20Q9Y6A4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP20Q9Y6A4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP20Q9Y6A4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP20Q9Y6A4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP20Q9Y6A4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP20Q9Y6A4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP20Q9Y6A4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP20Q9Y6A4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP20Q9Y6A4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP20Q9Y6A4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP20Q9Y6A4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP20Q9Y6A4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP20Q9Y6A4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP20Q9Y6A4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP20Q9Y6A4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP20Q9Y6A4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP20Q9Y6A4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP20Q9Y6A4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP20Q9Y6A4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP20Q9Y6A4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP20Q9Y6A4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP20Q9Y6A4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP20Q9Y6A4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP20Q9Y6A4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP20Q9Y6A4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP20Q9Y6A4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP20Q9Y6A4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP20Q9Y6A4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP20Q9Y6A4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP20Q9Y6A4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms