Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E1

PCDHB9, Protocadherin beta-9, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB9Q9Y5E1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCDHB9Q9Y5E1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCDHB9Q9Y5E1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCDHB9Q9Y5E1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCDHB9Q9Y5E1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDHB9Q9Y5E1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDHB9Q9Y5E1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDHB9Q9Y5E1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDHB9Q9Y5E1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDHB9Q9Y5E1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDHB9Q9Y5E1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDHB9Q9Y5E1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDHB9Q9Y5E1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDHB9Q9Y5E1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDHB9Q9Y5E1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDHB9Q9Y5E1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDHB9Q9Y5E1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDHB9Q9Y5E1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDHB9Q9Y5E1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCDHB9Q9Y5E1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCDHB9Q9Y5E1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCDHB9Q9Y5E1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCDHB9Q9Y5E1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCDHB9Q9Y5E1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCDHB9Q9Y5E1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCDHB9Q9Y5E1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCDHB9Q9Y5E1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDHB9Q9Y5E1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDHB9Q9Y5E1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDHB9Q9Y5E1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDHB9Q9Y5E1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDHB9Q9Y5E1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHB9Q9Y5E1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHB9Q9Y5E1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHB9Q9Y5E1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHB9Q9Y5E1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHB9Q9Y5E1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHB9Q9Y5E1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHB9Q9Y5E1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHB9Q9Y5E1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHB9Q9Y5E1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHB9Q9Y5E1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHB9Q9Y5E1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHB9Q9Y5E1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHB9Q9Y5E1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHB9Q9Y5E1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHB9Q9Y5E1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHB9Q9Y5E1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHB9Q9Y5E1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHB9Q9Y5E1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHB9Q9Y5E1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHB9Q9Y5E1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHB9Q9Y5E1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHB9Q9Y5E1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHB9Q9Y5E1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHB9Q9Y5E1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHB9Q9Y5E1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHB9Q9Y5E1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHB9Q9Y5E1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHB9Q9Y5E1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHB9Q9Y5E1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHB9Q9Y5E1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHB9Q9Y5E1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHB9Q9Y5E1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHB9Q9Y5E1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHB9Q9Y5E1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHB9Q9Y5E1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHB9Q9Y5E1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHB9Q9Y5E1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHB9Q9Y5E1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHB9Q9Y5E1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHB9Q9Y5E1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHB9Q9Y5E1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHB9Q9Y5E1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHB9Q9Y5E1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHB9Q9Y5E1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHB9Q9Y5E1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHB9Q9Y5E1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHB9Q9Y5E1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHB9Q9Y5E1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHB9Q9Y5E1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHB9Q9Y5E1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHB9Q9Y5E1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHB9Q9Y5E1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHB9Q9Y5E1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHB9Q9Y5E1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHB9Q9Y5E1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHB9Q9Y5E1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHB9Q9Y5E1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHB9Q9Y5E1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHB9Q9Y5E1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHB9Q9Y5E1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHB9Q9Y5E1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHB9Q9Y5E1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHB9Q9Y5E1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHB9Q9Y5E1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHB9Q9Y5E1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHB9Q9Y5E1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHB9Q9Y5E1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHB9Q9Y5E1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms