Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3R0

GRIP1, Glutamate receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIP1Q9Y3R0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIP1Q9Y3R0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIP1Q9Y3R0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIP1Q9Y3R0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIP1Q9Y3R0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIP1Q9Y3R0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIP1Q9Y3R0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIP1Q9Y3R0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIP1Q9Y3R0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIP1Q9Y3R0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIP1Q9Y3R0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIP1Q9Y3R0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIP1Q9Y3R0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIP1Q9Y3R0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIP1Q9Y3R0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIP1Q9Y3R0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIP1Q9Y3R0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIP1Q9Y3R0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIP1Q9Y3R0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIP1Q9Y3R0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIP1Q9Y3R0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIP1Q9Y3R0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIP1Q9Y3R0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIP1Q9Y3R0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIP1Q9Y3R0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIP1Q9Y3R0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIP1Q9Y3R0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIP1Q9Y3R0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIP1Q9Y3R0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIP1Q9Y3R0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIP1Q9Y3R0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIP1Q9Y3R0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIP1Q9Y3R0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIP1Q9Y3R0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIP1Q9Y3R0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIP1Q9Y3R0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIP1Q9Y3R0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIP1Q9Y3R0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIP1Q9Y3R0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRIP1Q9Y3R0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIP1Q9Y3R0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIP1Q9Y3R0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIP1Q9Y3R0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIP1Q9Y3R0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIP1Q9Y3R0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIP1Q9Y3R0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIP1Q9Y3R0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIP1Q9Y3R0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIP1Q9Y3R0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIP1Q9Y3R0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIP1Q9Y3R0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIP1Q9Y3R0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIP1Q9Y3R0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIP1Q9Y3R0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIP1Q9Y3R0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIP1Q9Y3R0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIP1Q9Y3R0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIP1Q9Y3R0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIP1Q9Y3R0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIP1Q9Y3R0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIP1Q9Y3R0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIP1Q9Y3R0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIP1Q9Y3R0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIP1Q9Y3R0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIP1Q9Y3R0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIP1Q9Y3R0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIP1Q9Y3R0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIP1Q9Y3R0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIP1Q9Y3R0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIP1Q9Y3R0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIP1Q9Y3R0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIP1Q9Y3R0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIP1Q9Y3R0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIP1Q9Y3R0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIP1Q9Y3R0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIP1Q9Y3R0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIP1Q9Y3R0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIP1Q9Y3R0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIP1Q9Y3R0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIP1Q9Y3R0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIP1Q9Y3R0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIP1Q9Y3R0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIP1Q9Y3R0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIP1Q9Y3R0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIP1Q9Y3R0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIP1Q9Y3R0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIP1Q9Y3R0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIP1Q9Y3R0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIP1Q9Y3R0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIP1Q9Y3R0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIP1Q9Y3R0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIP1Q9Y3R0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIP1Q9Y3R0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIP1Q9Y3R0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIP1Q9Y3R0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIP1Q9Y3R0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIP1Q9Y3R0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIP1Q9Y3R0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIP1Q9Y3R0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIP1Q9Y3R0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms