Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B9

RRP15, RRP15-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP15Q9Y3B9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP15Q9Y3B9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRP15Q9Y3B9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRP15Q9Y3B9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRP15Q9Y3B9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRP15Q9Y3B9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRP15Q9Y3B9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RRP15Q9Y3B9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRP15Q9Y3B9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRP15Q9Y3B9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRP15Q9Y3B9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRP15Q9Y3B9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRP15Q9Y3B9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRP15Q9Y3B9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRP15Q9Y3B9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRP15Q9Y3B9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRP15Q9Y3B9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRP15Q9Y3B9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRP15Q9Y3B9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRP15Q9Y3B9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RRP15Q9Y3B9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RRP15Q9Y3B9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRP15Q9Y3B9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRP15Q9Y3B9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRP15Q9Y3B9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRP15Q9Y3B9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRP15Q9Y3B9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRP15Q9Y3B9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRP15Q9Y3B9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRP15Q9Y3B9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRP15Q9Y3B9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRP15Q9Y3B9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRP15Q9Y3B9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRP15Q9Y3B9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRP15Q9Y3B9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRP15Q9Y3B9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RRP15Q9Y3B9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRP15Q9Y3B9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRP15Q9Y3B9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRP15Q9Y3B9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RRP15Q9Y3B9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRP15Q9Y3B9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRP15Q9Y3B9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RRP15Q9Y3B9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRP15Q9Y3B9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRP15Q9Y3B9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRP15Q9Y3B9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRP15Q9Y3B9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRP15Q9Y3B9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRP15Q9Y3B9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRP15Q9Y3B9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRP15Q9Y3B9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRP15Q9Y3B9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRP15Q9Y3B9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRP15Q9Y3B9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRP15Q9Y3B9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRP15Q9Y3B9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRP15Q9Y3B9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRP15Q9Y3B9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRP15Q9Y3B9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRP15Q9Y3B9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRP15Q9Y3B9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRP15Q9Y3B9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RRP15Q9Y3B9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRP15Q9Y3B9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP15Q9Y3B9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP15Q9Y3B9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP15Q9Y3B9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP15Q9Y3B9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP15Q9Y3B9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP15Q9Y3B9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP15Q9Y3B9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP15Q9Y3B9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP15Q9Y3B9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRP15Q9Y3B9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRP15Q9Y3B9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRP15Q9Y3B9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRP15Q9Y3B9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRP15Q9Y3B9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRP15Q9Y3B9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRP15Q9Y3B9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRP15Q9Y3B9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRP15Q9Y3B9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RRP15Q9Y3B9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRP15Q9Y3B9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRP15Q9Y3B9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRP15Q9Y3B9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRP15Q9Y3B9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRP15Q9Y3B9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRP15Q9Y3B9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRP15Q9Y3B9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRP15Q9Y3B9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRP15Q9Y3B9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP15Q9Y3B9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP15Q9Y3B9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP15Q9Y3B9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP15Q9Y3B9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP15Q9Y3B9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP15Q9Y3B9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP15Q9Y3B9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms