Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B2

EXOSC1, Exosome complex component CSL4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC1Q9Y3B2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC1Q9Y3B2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC1Q9Y3B2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC1Q9Y3B2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC1Q9Y3B2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC1Q9Y3B2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC1Q9Y3B2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC1Q9Y3B2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC1Q9Y3B2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC1Q9Y3B2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC1Q9Y3B2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC1Q9Y3B2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC1Q9Y3B2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC1Q9Y3B2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC1Q9Y3B2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC1Q9Y3B2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC1Q9Y3B2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC1Q9Y3B2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC1Q9Y3B2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC1Q9Y3B2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC1Q9Y3B2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC1Q9Y3B2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC1Q9Y3B2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC1Q9Y3B2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC1Q9Y3B2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC1Q9Y3B2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC1Q9Y3B2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC1Q9Y3B2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC1Q9Y3B2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC1Q9Y3B2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EXOSC1Q9Y3B2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EXOSC1Q9Y3B2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EXOSC1Q9Y3B2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXOSC1Q9Y3B2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXOSC1Q9Y3B2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXOSC1Q9Y3B2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXOSC1Q9Y3B2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC1Q9Y3B2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC1Q9Y3B2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC1Q9Y3B2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC1Q9Y3B2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC1Q9Y3B2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC1Q9Y3B2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC1Q9Y3B2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC1Q9Y3B2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC1Q9Y3B2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC1Q9Y3B2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC1Q9Y3B2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC1Q9Y3B2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC1Q9Y3B2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC1Q9Y3B2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC1Q9Y3B2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC1Q9Y3B2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC1Q9Y3B2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC1Q9Y3B2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC1Q9Y3B2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC1Q9Y3B2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC1Q9Y3B2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC1Q9Y3B2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC1Q9Y3B2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EXOSC1Q9Y3B2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EXOSC1Q9Y3B2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EXOSC1Q9Y3B2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC1Q9Y3B2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC1Q9Y3B2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC1Q9Y3B2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC1Q9Y3B2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC1Q9Y3B2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC1Q9Y3B2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC1Q9Y3B2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC1Q9Y3B2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC1Q9Y3B2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC1Q9Y3B2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC1Q9Y3B2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC1Q9Y3B2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC1Q9Y3B2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC1Q9Y3B2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC1Q9Y3B2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC1Q9Y3B2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC1Q9Y3B2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC1Q9Y3B2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC1Q9Y3B2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC1Q9Y3B2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC1Q9Y3B2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC1Q9Y3B2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC1Q9Y3B2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC1Q9Y3B2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC1Q9Y3B2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC1Q9Y3B2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC1Q9Y3B2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC1Q9Y3B2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC1Q9Y3B2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC1Q9Y3B2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC1Q9Y3B2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC1Q9Y3B2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC1Q9Y3B2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC1Q9Y3B2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC1Q9Y3B2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC1Q9Y3B2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC1Q9Y3B2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms