Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRELID3BQ9Y3B1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRELID3BQ9Y3B1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRELID3BQ9Y3B1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRELID3BQ9Y3B1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRELID3BQ9Y3B1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRELID3BQ9Y3B1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRELID3BQ9Y3B1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PRELID3BQ9Y3B1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PRELID3BQ9Y3B1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRELID3BQ9Y3B1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRELID3BQ9Y3B1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRELID3BQ9Y3B1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PRELID3BQ9Y3B1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRELID3BQ9Y3B1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRELID3BQ9Y3B1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRELID3BQ9Y3B1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRELID3BQ9Y3B1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PRELID3BQ9Y3B1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PRELID3BQ9Y3B1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRELID3BQ9Y3B1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRELID3BQ9Y3B1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRELID3BQ9Y3B1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRELID3BQ9Y3B1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRELID3BQ9Y3B1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRELID3BQ9Y3B1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRELID3BQ9Y3B1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRELID3BQ9Y3B1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRELID3BQ9Y3B1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRELID3BQ9Y3B1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRELID3BQ9Y3B1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PRELID3BQ9Y3B1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRELID3BQ9Y3B1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRELID3BQ9Y3B1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRELID3BQ9Y3B1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRELID3BQ9Y3B1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRELID3BQ9Y3B1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRELID3BQ9Y3B1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRELID3BQ9Y3B1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRELID3BQ9Y3B1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRELID3BQ9Y3B1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRELID3BQ9Y3B1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRELID3BQ9Y3B1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRELID3BQ9Y3B1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRELID3BQ9Y3B1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRELID3BQ9Y3B1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRELID3BQ9Y3B1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRELID3BQ9Y3B1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRELID3BQ9Y3B1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms