Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1DQ9Y2S0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1DQ9Y2S0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1DQ9Y2S0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1DQ9Y2S0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1DQ9Y2S0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1DQ9Y2S0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1DQ9Y2S0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1DQ9Y2S0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1DQ9Y2S0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1DQ9Y2S0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR1DQ9Y2S0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
POLR1DQ9Y2S0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1DQ9Y2S0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1DQ9Y2S0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1DQ9Y2S0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1DQ9Y2S0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1DQ9Y2S0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1DQ9Y2S0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1DQ9Y2S0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1DQ9Y2S0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1DQ9Y2S0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1DQ9Y2S0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1DQ9Y2S0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1DQ9Y2S0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1DQ9Y2S0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1DQ9Y2S0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1DQ9Y2S0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1DQ9Y2S0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1DQ9Y2S0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1DQ9Y2S0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1DQ9Y2S0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1DQ9Y2S0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1DQ9Y2S0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1DQ9Y2S0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1DQ9Y2S0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1DQ9Y2S0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1DQ9Y2S0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1DQ9Y2S0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1DQ9Y2S0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1DQ9Y2S0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1DQ9Y2S0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1DQ9Y2S0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1DQ9Y2S0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1DQ9Y2S0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1DQ9Y2S0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1DQ9Y2S0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1DQ9Y2S0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1DQ9Y2S0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1DQ9Y2S0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1DQ9Y2S0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1DQ9Y2S0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1DQ9Y2S0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1DQ9Y2S0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1DQ9Y2S0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1DQ9Y2S0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1DQ9Y2S0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1DQ9Y2S0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1DQ9Y2S0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1DQ9Y2S0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1DQ9Y2S0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1DQ9Y2S0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1DQ9Y2S0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1DQ9Y2S0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1DQ9Y2S0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1DQ9Y2S0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1DQ9Y2S0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1DQ9Y2S0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1DQ9Y2S0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1DQ9Y2S0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1DQ9Y2S0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1DQ9Y2S0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1DQ9Y2S0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1DQ9Y2S0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1DQ9Y2S0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1DQ9Y2S0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1DQ9Y2S0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1DQ9Y2S0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1DQ9Y2S0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR1DQ9Y2S0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR1DQ9Y2S0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR1DQ9Y2S0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR1DQ9Y2S0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1DQ9Y2S0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1DQ9Y2S0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1DQ9Y2S0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1DQ9Y2S0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1DQ9Y2S0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1DQ9Y2S0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1DQ9Y2S0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1DQ9Y2S0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1DQ9Y2S0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1DQ9Y2S0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1DQ9Y2S0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1DQ9Y2S0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1DQ9Y2S0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1DQ9Y2S0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1DQ9Y2S0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1DQ9Y2S0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1DQ9Y2S0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms