Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y282

ERGIC3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC3Q9Y282 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERGIC3Q9Y282 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERGIC3Q9Y282 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERGIC3Q9Y282 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERGIC3Q9Y282 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERGIC3Q9Y282 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERGIC3Q9Y282 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERGIC3Q9Y282 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERGIC3Q9Y282 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERGIC3Q9Y282 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERGIC3Q9Y282 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERGIC3Q9Y282 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERGIC3Q9Y282 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERGIC3Q9Y282 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERGIC3Q9Y282 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERGIC3Q9Y282 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERGIC3Q9Y282 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERGIC3Q9Y282 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERGIC3Q9Y282 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ERGIC3Q9Y282 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERGIC3Q9Y282 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERGIC3Q9Y282 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERGIC3Q9Y282 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERGIC3Q9Y282 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERGIC3Q9Y282 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERGIC3Q9Y282 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERGIC3Q9Y282 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERGIC3Q9Y282 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERGIC3Q9Y282 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERGIC3Q9Y282 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERGIC3Q9Y282 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERGIC3Q9Y282 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERGIC3Q9Y282 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ERGIC3Q9Y282 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERGIC3Q9Y282 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERGIC3Q9Y282 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERGIC3Q9Y282 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERGIC3Q9Y282 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERGIC3Q9Y282 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERGIC3Q9Y282 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERGIC3Q9Y282 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERGIC3Q9Y282 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERGIC3Q9Y282 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ERGIC3Q9Y282 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERGIC3Q9Y282 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERGIC3Q9Y282 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERGIC3Q9Y282 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERGIC3Q9Y282 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERGIC3Q9Y282 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERGIC3Q9Y282 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ERGIC3Q9Y282 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ERGIC3Q9Y282 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERGIC3Q9Y282 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERGIC3Q9Y282 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERGIC3Q9Y282 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERGIC3Q9Y282 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERGIC3Q9Y282 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERGIC3Q9Y282 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERGIC3Q9Y282 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERGIC3Q9Y282 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERGIC3Q9Y282 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERGIC3Q9Y282 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERGIC3Q9Y282 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERGIC3Q9Y282 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERGIC3Q9Y282 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERGIC3Q9Y282 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERGIC3Q9Y282 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ERGIC3Q9Y282 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERGIC3Q9Y282 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ERGIC3Q9Y282 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERGIC3Q9Y282 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERGIC3Q9Y282 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERGIC3Q9Y282 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERGIC3Q9Y282 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERGIC3Q9Y282 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERGIC3Q9Y282 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERGIC3Q9Y282 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERGIC3Q9Y282 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERGIC3Q9Y282 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERGIC3Q9Y282 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERGIC3Q9Y282 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERGIC3Q9Y282 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERGIC3Q9Y282 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERGIC3Q9Y282 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERGIC3Q9Y282 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERGIC3Q9Y282 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERGIC3Q9Y282 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERGIC3Q9Y282 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERGIC3Q9Y282 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERGIC3Q9Y282 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERGIC3Q9Y282 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERGIC3Q9Y282 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERGIC3Q9Y282 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERGIC3Q9Y282 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERGIC3Q9Y282 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERGIC3Q9Y282 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERGIC3Q9Y282 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERGIC3Q9Y282 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERGIC3Q9Y282 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERGIC3Q9Y282 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms