Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TNNQ9UQP3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TNNQ9UQP3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TNNQ9UQP3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TNNQ9UQP3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TNNQ9UQP3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TNNQ9UQP3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TNNQ9UQP3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TNNQ9UQP3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TNNQ9UQP3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TNNQ9UQP3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TNNQ9UQP3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TNNQ9UQP3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TNNQ9UQP3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TNNQ9UQP3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TNNQ9UQP3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TNNQ9UQP3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TNNQ9UQP3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TNNQ9UQP3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TNNQ9UQP3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
TNNQ9UQP3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
TNNQ9UQP3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
TNNQ9UQP3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
TNNQ9UQP3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
TNNQ9UQP3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
TNNQ9UQP3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
TNNQ9UQP3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
TNNQ9UQP3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
TNNQ9UQP3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TNNQ9UQP3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TNNQ9UQP3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TNNQ9UQP3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TNNQ9UQP3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TNNQ9UQP3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TNNQ9UQP3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TNNQ9UQP3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TNNQ9UQP3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TNNQ9UQP3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TNNQ9UQP3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TNNQ9UQP3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TNNQ9UQP3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TNNQ9UQP3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TNNQ9UQP3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TNNQ9UQP3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TNNQ9UQP3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TNNQ9UQP3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TNNQ9UQP3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
TNNQ9UQP3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TNNQ9UQP3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TNNQ9UQP3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
TNNQ9UQP3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TNNQ9UQP3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TNNQ9UQP3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TNNQ9UQP3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TNNQ9UQP3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TNNQ9UQP3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TNNQ9UQP3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TNNQ9UQP3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TNNQ9UQP3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TNNQ9UQP3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TNNQ9UQP3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TNNQ9UQP3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TNNQ9UQP3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TNNQ9UQP3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TNNQ9UQP3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TNNQ9UQP3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
TNNQ9UQP3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
TNNQ9UQP3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
TNNQ9UQP3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
TNNQ9UQP3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
TNNQ9UQP3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TNNQ9UQP3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TNNQ9UQP3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TNNQ9UQP3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TNNQ9UQP3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TNNQ9UQP3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TNNQ9UQP3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TNNQ9UQP3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TNNQ9UQP3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TNNQ9UQP3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TNNQ9UQP3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TNNQ9UQP3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TNNQ9UQP3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TNNQ9UQP3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TNNQ9UQP3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TNNQ9UQP3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TNNQ9UQP3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TNNQ9UQP3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TNNQ9UQP3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
TNNQ9UQP3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TNNQ9UQP3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TNNQ9UQP3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TNNQ9UQP3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TNNQ9UQP3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TNNQ9UQP3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TNNQ9UQP3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TNNQ9UQP3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TNNQ9UQP3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
TNNQ9UQP3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TNNQ9UQP3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms