Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYNRGQ9UMZ2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYNRGQ9UMZ2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SYNRGQ9UMZ2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SYNRGQ9UMZ2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SYNRGQ9UMZ2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SYNRGQ9UMZ2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNRGQ9UMZ2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNRGQ9UMZ2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNRGQ9UMZ2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNRGQ9UMZ2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNRGQ9UMZ2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNRGQ9UMZ2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNRGQ9UMZ2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNRGQ9UMZ2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYNRGQ9UMZ2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYNRGQ9UMZ2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYNRGQ9UMZ2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYNRGQ9UMZ2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYNRGQ9UMZ2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNRGQ9UMZ2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNRGQ9UMZ2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYNRGQ9UMZ2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYNRGQ9UMZ2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SYNRGQ9UMZ2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNRGQ9UMZ2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNRGQ9UMZ2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNRGQ9UMZ2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNRGQ9UMZ2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNRGQ9UMZ2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNRGQ9UMZ2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNRGQ9UMZ2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNRGQ9UMZ2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNRGQ9UMZ2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNRGQ9UMZ2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNRGQ9UMZ2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNRGQ9UMZ2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNRGQ9UMZ2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNRGQ9UMZ2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNRGQ9UMZ2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNRGQ9UMZ2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNRGQ9UMZ2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SYNRGQ9UMZ2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SYNRGQ9UMZ2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
SYNRGQ9UMZ2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
SYNRGQ9UMZ2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNRGQ9UMZ2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNRGQ9UMZ2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNRGQ9UMZ2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNRGQ9UMZ2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNRGQ9UMZ2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNRGQ9UMZ2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNRGQ9UMZ2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNRGQ9UMZ2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYNRGQ9UMZ2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYNRGQ9UMZ2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYNRGQ9UMZ2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNRGQ9UMZ2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNRGQ9UMZ2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNRGQ9UMZ2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYNRGQ9UMZ2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYNRGQ9UMZ2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYNRGQ9UMZ2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SYNRGQ9UMZ2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYNRGQ9UMZ2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYNRGQ9UMZ2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYNRGQ9UMZ2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYNRGQ9UMZ2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYNRGQ9UMZ2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYNRGQ9UMZ2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYNRGQ9UMZ2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYNRGQ9UMZ2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYNRGQ9UMZ2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYNRGQ9UMZ2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYNRGQ9UMZ2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNRGQ9UMZ2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNRGQ9UMZ2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNRGQ9UMZ2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNRGQ9UMZ2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNRGQ9UMZ2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNRGQ9UMZ2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNRGQ9UMZ2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNRGQ9UMZ2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNRGQ9UMZ2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNRGQ9UMZ2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNRGQ9UMZ2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNRGQ9UMZ2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNRGQ9UMZ2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNRGQ9UMZ2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNRGQ9UMZ2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNRGQ9UMZ2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNRGQ9UMZ2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SYNRGQ9UMZ2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SYNRGQ9UMZ2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYNRGQ9UMZ2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYNRGQ9UMZ2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNRGQ9UMZ2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNRGQ9UMZ2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNRGQ9UMZ2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNRGQ9UMZ2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms