Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR5

PPT2, Lysosomal thioesterase PPT2, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT2Q9UMR5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPT2Q9UMR5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPT2Q9UMR5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPT2Q9UMR5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPT2Q9UMR5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPT2Q9UMR5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPT2Q9UMR5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPT2Q9UMR5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPT2Q9UMR5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPT2Q9UMR5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPT2Q9UMR5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPT2Q9UMR5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPT2Q9UMR5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPT2Q9UMR5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPT2Q9UMR5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPT2Q9UMR5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPT2Q9UMR5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPT2Q9UMR5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPT2Q9UMR5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPT2Q9UMR5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PPT2Q9UMR5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPT2Q9UMR5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPT2Q9UMR5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPT2Q9UMR5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPT2Q9UMR5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPT2Q9UMR5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPT2Q9UMR5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PPT2Q9UMR5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PPT2Q9UMR5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPT2Q9UMR5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPT2Q9UMR5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPT2Q9UMR5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPT2Q9UMR5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPT2Q9UMR5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPT2Q9UMR5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPT2Q9UMR5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPT2Q9UMR5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPT2Q9UMR5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPT2Q9UMR5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPT2Q9UMR5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPT2Q9UMR5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPT2Q9UMR5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPT2Q9UMR5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPT2Q9UMR5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPT2Q9UMR5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPT2Q9UMR5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPT2Q9UMR5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPT2Q9UMR5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPT2Q9UMR5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPT2Q9UMR5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPT2Q9UMR5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPT2Q9UMR5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPT2Q9UMR5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPT2Q9UMR5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPT2Q9UMR5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPT2Q9UMR5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPT2Q9UMR5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPT2Q9UMR5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPT2Q9UMR5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPT2Q9UMR5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPT2Q9UMR5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPT2Q9UMR5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPT2Q9UMR5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPT2Q9UMR5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPT2Q9UMR5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPT2Q9UMR5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPT2Q9UMR5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPT2Q9UMR5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPT2Q9UMR5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPT2Q9UMR5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPT2Q9UMR5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPT2Q9UMR5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPT2Q9UMR5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PPT2Q9UMR5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PPT2Q9UMR5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PPT2Q9UMR5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PPT2Q9UMR5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PPT2Q9UMR5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PPT2Q9UMR5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PPT2Q9UMR5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PPT2Q9UMR5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PPT2Q9UMR5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPT2Q9UMR5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPT2Q9UMR5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPT2Q9UMR5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPT2Q9UMR5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPT2Q9UMR5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPT2Q9UMR5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPT2Q9UMR5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPT2Q9UMR5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPT2Q9UMR5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPT2Q9UMR5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPT2Q9UMR5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPT2Q9UMR5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPT2Q9UMR5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPT2Q9UMR5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPT2Q9UMR5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPT2Q9UMR5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PPT2Q9UMR5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PPT2Q9UMR5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms