Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRID1Q9ULK0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRID1Q9ULK0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRID1Q9ULK0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRID1Q9ULK0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRID1Q9ULK0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRID1Q9ULK0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRID1Q9ULK0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRID1Q9ULK0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRID1Q9ULK0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRID1Q9ULK0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRID1Q9ULK0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRID1Q9ULK0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRID1Q9ULK0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRID1Q9ULK0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GRID1Q9ULK0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRID1Q9ULK0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRID1Q9ULK0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRID1Q9ULK0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRID1Q9ULK0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRID1Q9ULK0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRID1Q9ULK0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRID1Q9ULK0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRID1Q9ULK0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRID1Q9ULK0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRID1Q9ULK0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRID1Q9ULK0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRID1Q9ULK0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRID1Q9ULK0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRID1Q9ULK0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GRID1Q9ULK0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRID1Q9ULK0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRID1Q9ULK0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRID1Q9ULK0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRID1Q9ULK0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRID1Q9ULK0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GRID1Q9ULK0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRID1Q9ULK0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRID1Q9ULK0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRID1Q9ULK0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRID1Q9ULK0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GRID1Q9ULK0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRID1Q9ULK0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRID1Q9ULK0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRID1Q9ULK0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRID1Q9ULK0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GRID1Q9ULK0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRID1Q9ULK0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRID1Q9ULK0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRID1Q9ULK0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRID1Q9ULK0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
GRID1Q9ULK0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRID1Q9ULK0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRID1Q9ULK0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRID1Q9ULK0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRID1Q9ULK0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRID1Q9ULK0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GRID1Q9ULK0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GRID1Q9ULK0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GRID1Q9ULK0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GRID1Q9ULK0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRID1Q9ULK0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GRID1Q9ULK0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRID1Q9ULK0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRID1Q9ULK0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRID1Q9ULK0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRID1Q9ULK0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRID1Q9ULK0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRID1Q9ULK0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRID1Q9ULK0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRID1Q9ULK0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRID1Q9ULK0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRID1Q9ULK0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRID1Q9ULK0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRID1Q9ULK0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRID1Q9ULK0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRID1Q9ULK0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GRID1Q9ULK0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GRID1Q9ULK0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRID1Q9ULK0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRID1Q9ULK0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRID1Q9ULK0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRID1Q9ULK0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRID1Q9ULK0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRID1Q9ULK0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRID1Q9ULK0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRID1Q9ULK0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRID1Q9ULK0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRID1Q9ULK0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRID1Q9ULK0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRID1Q9ULK0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRID1Q9ULK0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GRID1Q9ULK0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRID1Q9ULK0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRID1Q9ULK0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRID1Q9ULK0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRID1Q9ULK0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRID1Q9ULK0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRID1Q9ULK0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRID1Q9ULK0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms