Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIMKLBQ9ULI2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIMKLBQ9ULI2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIMKLBQ9ULI2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIMKLBQ9ULI2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIMKLBQ9ULI2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIMKLBQ9ULI2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIMKLBQ9ULI2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIMKLBQ9ULI2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIMKLBQ9ULI2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIMKLBQ9ULI2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIMKLBQ9ULI2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIMKLBQ9ULI2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RIMKLBQ9ULI2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RIMKLBQ9ULI2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RIMKLBQ9ULI2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIMKLBQ9ULI2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIMKLBQ9ULI2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIMKLBQ9ULI2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIMKLBQ9ULI2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIMKLBQ9ULI2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RIMKLBQ9ULI2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RIMKLBQ9ULI2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RIMKLBQ9ULI2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIMKLBQ9ULI2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIMKLBQ9ULI2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIMKLBQ9ULI2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RIMKLBQ9ULI2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIMKLBQ9ULI2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIMKLBQ9ULI2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIMKLBQ9ULI2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RIMKLBQ9ULI2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIMKLBQ9ULI2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIMKLBQ9ULI2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIMKLBQ9ULI2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIMKLBQ9ULI2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIMKLBQ9ULI2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIMKLBQ9ULI2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIMKLBQ9ULI2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIMKLBQ9ULI2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIMKLBQ9ULI2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIMKLBQ9ULI2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIMKLBQ9ULI2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIMKLBQ9ULI2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIMKLBQ9ULI2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIMKLBQ9ULI2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIMKLBQ9ULI2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIMKLBQ9ULI2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIMKLBQ9ULI2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIMKLBQ9ULI2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIMKLBQ9ULI2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIMKLBQ9ULI2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIMKLBQ9ULI2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIMKLBQ9ULI2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIMKLBQ9ULI2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIMKLBQ9ULI2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RIMKLBQ9ULI2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIMKLBQ9ULI2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIMKLBQ9ULI2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIMKLBQ9ULI2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIMKLBQ9ULI2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIMKLBQ9ULI2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIMKLBQ9ULI2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIMKLBQ9ULI2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIMKLBQ9ULI2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIMKLBQ9ULI2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIMKLBQ9ULI2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIMKLBQ9ULI2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIMKLBQ9ULI2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIMKLBQ9ULI2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIMKLBQ9ULI2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIMKLBQ9ULI2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIMKLBQ9ULI2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIMKLBQ9ULI2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIMKLBQ9ULI2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIMKLBQ9ULI2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIMKLBQ9ULI2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIMKLBQ9ULI2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RIMKLBQ9ULI2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RIMKLBQ9ULI2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RIMKLBQ9ULI2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RIMKLBQ9ULI2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RIMKLBQ9ULI2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RIMKLBQ9ULI2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIMKLBQ9ULI2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIMKLBQ9ULI2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIMKLBQ9ULI2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIMKLBQ9ULI2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIMKLBQ9ULI2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIMKLBQ9ULI2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIMKLBQ9ULI2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RIMKLBQ9ULI2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIMKLBQ9ULI2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIMKLBQ9ULI2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIMKLBQ9ULI2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIMKLBQ9ULI2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIMKLBQ9ULI2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIMKLBQ9ULI2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIMKLBQ9ULI2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIMKLBQ9ULI2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms