Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
CHIC2Q9UKJ5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
CHIC2Q9UKJ5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
CHIC2Q9UKJ5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CHIC2Q9UKJ5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
CHIC2Q9UKJ5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
CHIC2Q9UKJ5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
CHIC2Q9UKJ5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CHIC2Q9UKJ5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CHIC2Q9UKJ5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CHIC2Q9UKJ5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
CHIC2Q9UKJ5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CHIC2Q9UKJ5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
CHIC2Q9UKJ5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC38.13■■■■□ 3.69
CHIC2Q9UKJ5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
CHIC2Q9UKJ5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
CHIC2Q9UKJ5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CHIC2Q9UKJ5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CHIC2Q9UKJ5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CHIC2Q9UKJ5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC38.11■■■■□ 3.69
CHIC2Q9UKJ5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
CHIC2Q9UKJ5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
CHIC2Q9UKJ5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
CHIC2Q9UKJ5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
CHIC2Q9UKJ5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
CHIC2Q9UKJ5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
CHIC2Q9UKJ5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
CHIC2Q9UKJ5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CHIC2Q9UKJ5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CHIC2Q9UKJ5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
CHIC2Q9UKJ5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
CHIC2Q9UKJ5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
CHIC2Q9UKJ5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CHIC2Q9UKJ5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CHIC2Q9UKJ5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CHIC2Q9UKJ5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CHIC2Q9UKJ5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CHIC2Q9UKJ5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CHIC2Q9UKJ5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
CHIC2Q9UKJ5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
CHIC2Q9UKJ5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
CHIC2Q9UKJ5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
CHIC2Q9UKJ5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
CHIC2Q9UKJ5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
CHIC2Q9UKJ5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.68
CHIC2Q9UKJ5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
CHIC2Q9UKJ5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CHIC2Q9UKJ5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CHIC2Q9UKJ5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CHIC2Q9UKJ5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CHIC2Q9UKJ5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CHIC2Q9UKJ5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CHIC2Q9UKJ5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CHIC2Q9UKJ5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CHIC2Q9UKJ5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CHIC2Q9UKJ5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
CHIC2Q9UKJ5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CHIC2Q9UKJ5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CHIC2Q9UKJ5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CHIC2Q9UKJ5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
CHIC2Q9UKJ5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CHIC2Q9UKJ5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CHIC2Q9UKJ5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CHIC2Q9UKJ5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CHIC2Q9UKJ5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CHIC2Q9UKJ5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CHIC2Q9UKJ5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CHIC2Q9UKJ5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CHIC2Q9UKJ5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CHIC2Q9UKJ5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
CHIC2Q9UKJ5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
CHIC2Q9UKJ5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
CHIC2Q9UKJ5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CHIC2Q9UKJ5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CHIC2Q9UKJ5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CHIC2Q9UKJ5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CHIC2Q9UKJ5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CHIC2Q9UKJ5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CHIC2Q9UKJ5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CHIC2Q9UKJ5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CHIC2Q9UKJ5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CHIC2Q9UKJ5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CHIC2Q9UKJ5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
CHIC2Q9UKJ5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CHIC2Q9UKJ5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
CHIC2Q9UKJ5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CHIC2Q9UKJ5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CHIC2Q9UKJ5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CHIC2Q9UKJ5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CHIC2Q9UKJ5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CHIC2Q9UKJ5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
CHIC2Q9UKJ5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CHIC2Q9UKJ5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
CHIC2Q9UKJ5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CHIC2Q9UKJ5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CHIC2Q9UKJ5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
CHIC2Q9UKJ5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CHIC2Q9UKJ5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CHIC2Q9UKJ5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
CHIC2Q9UKJ5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms