Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
USP21Q9UK80 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
USP21Q9UK80 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
USP21Q9UK80 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
USP21Q9UK80 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
USP21Q9UK80 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
USP21Q9UK80 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
USP21Q9UK80 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
USP21Q9UK80 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
USP21Q9UK80 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
USP21Q9UK80 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
USP21Q9UK80 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
USP21Q9UK80 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
USP21Q9UK80 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
USP21Q9UK80 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
USP21Q9UK80 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
USP21Q9UK80 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
USP21Q9UK80 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
USP21Q9UK80 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
USP21Q9UK80 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
USP21Q9UK80 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
USP21Q9UK80 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
USP21Q9UK80 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
USP21Q9UK80 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
USP21Q9UK80 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
USP21Q9UK80 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
USP21Q9UK80 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
USP21Q9UK80 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
USP21Q9UK80 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
USP21Q9UK80 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
USP21Q9UK80 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
USP21Q9UK80 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
USP21Q9UK80 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
USP21Q9UK80 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
USP21Q9UK80 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
USP21Q9UK80 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
USP21Q9UK80 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
USP21Q9UK80 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
USP21Q9UK80 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
USP21Q9UK80 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
USP21Q9UK80 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
USP21Q9UK80 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
USP21Q9UK80 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
USP21Q9UK80 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
USP21Q9UK80 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
USP21Q9UK80 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
USP21Q9UK80 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
USP21Q9UK80 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
USP21Q9UK80 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
USP21Q9UK80 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
USP21Q9UK80 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
USP21Q9UK80 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
USP21Q9UK80 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
USP21Q9UK80 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
USP21Q9UK80 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
USP21Q9UK80 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
USP21Q9UK80 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
USP21Q9UK80 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
USP21Q9UK80 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
USP21Q9UK80 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
USP21Q9UK80 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
USP21Q9UK80 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
USP21Q9UK80 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
USP21Q9UK80 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
USP21Q9UK80 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
USP21Q9UK80 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
USP21Q9UK80 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
USP21Q9UK80 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
USP21Q9UK80 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
USP21Q9UK80 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
USP21Q9UK80 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
USP21Q9UK80 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
USP21Q9UK80 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
USP21Q9UK80 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
USP21Q9UK80 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
USP21Q9UK80 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
USP21Q9UK80 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
USP21Q9UK80 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
USP21Q9UK80 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
USP21Q9UK80 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC34.14■■■■□ 3.06
USP21Q9UK80 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC34.13■■■■□ 3.05
USP21Q9UK80 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
USP21Q9UK80 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
USP21Q9UK80 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
USP21Q9UK80 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
USP21Q9UK80 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
USP21Q9UK80 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
USP21Q9UK80 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
USP21Q9UK80 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC34.1■■■■□ 3.05
USP21Q9UK80 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
USP21Q9UK80 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
USP21Q9UK80 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
USP21Q9UK80 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
USP21Q9UK80 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
USP21Q9UK80 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
USP21Q9UK80 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
USP21Q9UK80 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
USP21Q9UK80 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
USP21Q9UK80 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
USP21Q9UK80 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms