Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK11

ZNF223, Zinc finger protein 223, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF223Q9UK11 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF223Q9UK11 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF223Q9UK11 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF223Q9UK11 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF223Q9UK11 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF223Q9UK11 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF223Q9UK11 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF223Q9UK11 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF223Q9UK11 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF223Q9UK11 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF223Q9UK11 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF223Q9UK11 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF223Q9UK11 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF223Q9UK11 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF223Q9UK11 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF223Q9UK11 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF223Q9UK11 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF223Q9UK11 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF223Q9UK11 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF223Q9UK11 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF223Q9UK11 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF223Q9UK11 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF223Q9UK11 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF223Q9UK11 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF223Q9UK11 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF223Q9UK11 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF223Q9UK11 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF223Q9UK11 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF223Q9UK11 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF223Q9UK11 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF223Q9UK11 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF223Q9UK11 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF223Q9UK11 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF223Q9UK11 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF223Q9UK11 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF223Q9UK11 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF223Q9UK11 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF223Q9UK11 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF223Q9UK11 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF223Q9UK11 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF223Q9UK11 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF223Q9UK11 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF223Q9UK11 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF223Q9UK11 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF223Q9UK11 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF223Q9UK11 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF223Q9UK11 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF223Q9UK11 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF223Q9UK11 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF223Q9UK11 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF223Q9UK11 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF223Q9UK11 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF223Q9UK11 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF223Q9UK11 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF223Q9UK11 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF223Q9UK11 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF223Q9UK11 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF223Q9UK11 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF223Q9UK11 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF223Q9UK11 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF223Q9UK11 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF223Q9UK11 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF223Q9UK11 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF223Q9UK11 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF223Q9UK11 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF223Q9UK11 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF223Q9UK11 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF223Q9UK11 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF223Q9UK11 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF223Q9UK11 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF223Q9UK11 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF223Q9UK11 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF223Q9UK11 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF223Q9UK11 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF223Q9UK11 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF223Q9UK11 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF223Q9UK11 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF223Q9UK11 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF223Q9UK11 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF223Q9UK11 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF223Q9UK11 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF223Q9UK11 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF223Q9UK11 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF223Q9UK11 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF223Q9UK11 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF223Q9UK11 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF223Q9UK11 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF223Q9UK11 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF223Q9UK11 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF223Q9UK11 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF223Q9UK11 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF223Q9UK11 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF223Q9UK11 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF223Q9UK11 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF223Q9UK11 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF223Q9UK11 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF223Q9UK11 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF223Q9UK11 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF223Q9UK11 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF223Q9UK11 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms