Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV9

DDX41, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX41, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX41Q9UJV9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX41Q9UJV9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX41Q9UJV9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX41Q9UJV9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX41Q9UJV9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDX41Q9UJV9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDX41Q9UJV9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDX41Q9UJV9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDX41Q9UJV9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDX41Q9UJV9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDX41Q9UJV9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
DDX41Q9UJV9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDX41Q9UJV9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX41Q9UJV9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX41Q9UJV9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX41Q9UJV9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX41Q9UJV9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX41Q9UJV9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDX41Q9UJV9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDX41Q9UJV9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDX41Q9UJV9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDX41Q9UJV9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
DDX41Q9UJV9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX41Q9UJV9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX41Q9UJV9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX41Q9UJV9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX41Q9UJV9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX41Q9UJV9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX41Q9UJV9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX41Q9UJV9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX41Q9UJV9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX41Q9UJV9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DDX41Q9UJV9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DDX41Q9UJV9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DDX41Q9UJV9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DDX41Q9UJV9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DDX41Q9UJV9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DDX41Q9UJV9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDX41Q9UJV9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDX41Q9UJV9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDX41Q9UJV9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDX41Q9UJV9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DDX41Q9UJV9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DDX41Q9UJV9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
DDX41Q9UJV9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DDX41Q9UJV9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DDX41Q9UJV9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DDX41Q9UJV9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DDX41Q9UJV9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DDX41Q9UJV9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDX41Q9UJV9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDX41Q9UJV9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDX41Q9UJV9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDX41Q9UJV9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DDX41Q9UJV9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDX41Q9UJV9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDX41Q9UJV9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDX41Q9UJV9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDX41Q9UJV9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
DDX41Q9UJV9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDX41Q9UJV9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDX41Q9UJV9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
DDX41Q9UJV9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
DDX41Q9UJV9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDX41Q9UJV9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDX41Q9UJV9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDX41Q9UJV9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
DDX41Q9UJV9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
DDX41Q9UJV9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
DDX41Q9UJV9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
DDX41Q9UJV9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DDX41Q9UJV9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DDX41Q9UJV9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDX41Q9UJV9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDX41Q9UJV9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDX41Q9UJV9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDX41Q9UJV9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDX41Q9UJV9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DDX41Q9UJV9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DDX41Q9UJV9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDX41Q9UJV9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
DDX41Q9UJV9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDX41Q9UJV9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DDX41Q9UJV9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DDX41Q9UJV9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
DDX41Q9UJV9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DDX41Q9UJV9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DDX41Q9UJV9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DDX41Q9UJV9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DDX41Q9UJV9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DDX41Q9UJV9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DDX41Q9UJV9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DDX41Q9UJV9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DDX41Q9UJV9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDX41Q9UJV9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDX41Q9UJV9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDX41Q9UJV9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDX41Q9UJV9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDX41Q9UJV9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDX41Q9UJV9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms