Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PUF60Q9UHX1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PUF60Q9UHX1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PUF60Q9UHX1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PUF60Q9UHX1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PUF60Q9UHX1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PUF60Q9UHX1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PUF60Q9UHX1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PUF60Q9UHX1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PUF60Q9UHX1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PUF60Q9UHX1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PUF60Q9UHX1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PUF60Q9UHX1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PUF60Q9UHX1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PUF60Q9UHX1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PUF60Q9UHX1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PUF60Q9UHX1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PUF60Q9UHX1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PUF60Q9UHX1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PUF60Q9UHX1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PUF60Q9UHX1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PUF60Q9UHX1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PUF60Q9UHX1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PUF60Q9UHX1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PUF60Q9UHX1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PUF60Q9UHX1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PUF60Q9UHX1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PUF60Q9UHX1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PUF60Q9UHX1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PUF60Q9UHX1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PUF60Q9UHX1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PUF60Q9UHX1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PUF60Q9UHX1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PUF60Q9UHX1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PUF60Q9UHX1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PUF60Q9UHX1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PUF60Q9UHX1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PUF60Q9UHX1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PUF60Q9UHX1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PUF60Q9UHX1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PUF60Q9UHX1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PUF60Q9UHX1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PUF60Q9UHX1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PUF60Q9UHX1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PUF60Q9UHX1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PUF60Q9UHX1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PUF60Q9UHX1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PUF60Q9UHX1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PUF60Q9UHX1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PUF60Q9UHX1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PUF60Q9UHX1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PUF60Q9UHX1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PUF60Q9UHX1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PUF60Q9UHX1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PUF60Q9UHX1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PUF60Q9UHX1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PUF60Q9UHX1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PUF60Q9UHX1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PUF60Q9UHX1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PUF60Q9UHX1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PUF60Q9UHX1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PUF60Q9UHX1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PUF60Q9UHX1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PUF60Q9UHX1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PUF60Q9UHX1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PUF60Q9UHX1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PUF60Q9UHX1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PUF60Q9UHX1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PUF60Q9UHX1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PUF60Q9UHX1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PUF60Q9UHX1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PUF60Q9UHX1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PUF60Q9UHX1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PUF60Q9UHX1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PUF60Q9UHX1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PUF60Q9UHX1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PUF60Q9UHX1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PUF60Q9UHX1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PUF60Q9UHX1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PUF60Q9UHX1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PUF60Q9UHX1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PUF60Q9UHX1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PUF60Q9UHX1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PUF60Q9UHX1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PUF60Q9UHX1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PUF60Q9UHX1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PUF60Q9UHX1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PUF60Q9UHX1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PUF60Q9UHX1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PUF60Q9UHX1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PUF60Q9UHX1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PUF60Q9UHX1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PUF60Q9UHX1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PUF60Q9UHX1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PUF60Q9UHX1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PUF60Q9UHX1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PUF60Q9UHX1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PUF60Q9UHX1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PUF60Q9UHX1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PUF60Q9UHX1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms