Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH77

KLHL3, Kelch-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL3Q9UH77 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL3Q9UH77 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL3Q9UH77 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL3Q9UH77 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL3Q9UH77 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL3Q9UH77 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL3Q9UH77 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL3Q9UH77 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL3Q9UH77 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL3Q9UH77 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL3Q9UH77 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL3Q9UH77 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL3Q9UH77 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL3Q9UH77 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL3Q9UH77 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL3Q9UH77 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL3Q9UH77 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL3Q9UH77 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL3Q9UH77 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL3Q9UH77 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL3Q9UH77 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL3Q9UH77 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL3Q9UH77 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KLHL3Q9UH77 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL3Q9UH77 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL3Q9UH77 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL3Q9UH77 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL3Q9UH77 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL3Q9UH77 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL3Q9UH77 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL3Q9UH77 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL3Q9UH77 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL3Q9UH77 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL3Q9UH77 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL3Q9UH77 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL3Q9UH77 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL3Q9UH77 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL3Q9UH77 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL3Q9UH77 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL3Q9UH77 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL3Q9UH77 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL3Q9UH77 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL3Q9UH77 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHL3Q9UH77 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL3Q9UH77 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL3Q9UH77 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL3Q9UH77 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL3Q9UH77 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL3Q9UH77 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL3Q9UH77 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL3Q9UH77 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL3Q9UH77 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL3Q9UH77 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL3Q9UH77 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL3Q9UH77 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL3Q9UH77 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL3Q9UH77 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL3Q9UH77 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL3Q9UH77 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL3Q9UH77 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL3Q9UH77 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL3Q9UH77 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL3Q9UH77 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL3Q9UH77 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL3Q9UH77 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL3Q9UH77 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL3Q9UH77 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL3Q9UH77 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL3Q9UH77 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL3Q9UH77 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL3Q9UH77 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL3Q9UH77 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL3Q9UH77 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL3Q9UH77 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KLHL3Q9UH77 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL3Q9UH77 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL3Q9UH77 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL3Q9UH77 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL3Q9UH77 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL3Q9UH77 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL3Q9UH77 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL3Q9UH77 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL3Q9UH77 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL3Q9UH77 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL3Q9UH77 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL3Q9UH77 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL3Q9UH77 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL3Q9UH77 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL3Q9UH77 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL3Q9UH77 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL3Q9UH77 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL3Q9UH77 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL3Q9UH77 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL3Q9UH77 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL3Q9UH77 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL3Q9UH77 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL3Q9UH77 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL3Q9UH77 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL3Q9UH77 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL3Q9UH77 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms