Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
KDM5BQ9UGL1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
KDM5BQ9UGL1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
KDM5BQ9UGL1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
KDM5BQ9UGL1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
KDM5BQ9UGL1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
KDM5BQ9UGL1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
KDM5BQ9UGL1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
KDM5BQ9UGL1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
KDM5BQ9UGL1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
KDM5BQ9UGL1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
KDM5BQ9UGL1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.02
KDM5BQ9UGL1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
KDM5BQ9UGL1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
KDM5BQ9UGL1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
KDM5BQ9UGL1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
KDM5BQ9UGL1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
KDM5BQ9UGL1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
KDM5BQ9UGL1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
KDM5BQ9UGL1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
KDM5BQ9UGL1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC40.1■■■■■ 4.01
KDM5BQ9UGL1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
KDM5BQ9UGL1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
KDM5BQ9UGL1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC40.08■■■■■ 4.01
KDM5BQ9UGL1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC40.08■■■■■ 4.01
KDM5BQ9UGL1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
KDM5BQ9UGL1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
KDM5BQ9UGL1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
KDM5BQ9UGL1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC40.06■■■■■ 4
KDM5BQ9UGL1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
KDM5BQ9UGL1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
KDM5BQ9UGL1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
KDM5BQ9UGL1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC40.04■■■■■ 4
KDM5BQ9UGL1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
KDM5BQ9UGL1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
KDM5BQ9UGL1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
KDM5BQ9UGL1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
KDM5BQ9UGL1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
KDM5BQ9UGL1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC40.02■■■■■ 4
KDM5BQ9UGL1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
KDM5BQ9UGL1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC40.01■■■■■ 4
KDM5BQ9UGL1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC40.01■■■■■ 4
KDM5BQ9UGL1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
KDM5BQ9UGL1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
KDM5BQ9UGL1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
KDM5BQ9UGL1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
KDM5BQ9UGL1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
KDM5BQ9UGL1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
KDM5BQ9UGL1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
KDM5BQ9UGL1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
KDM5BQ9UGL1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
KDM5BQ9UGL1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC39.96■■■■□ 3.99
KDM5BQ9UGL1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
KDM5BQ9UGL1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
KDM5BQ9UGL1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
KDM5BQ9UGL1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
KDM5BQ9UGL1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
KDM5BQ9UGL1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
KDM5BQ9UGL1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
KDM5BQ9UGL1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
KDM5BQ9UGL1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
KDM5BQ9UGL1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
KDM5BQ9UGL1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
KDM5BQ9UGL1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
KDM5BQ9UGL1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
KDM5BQ9UGL1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC39.93■■■■□ 3.98
KDM5BQ9UGL1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.92■■■■□ 3.98
KDM5BQ9UGL1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
KDM5BQ9UGL1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
KDM5BQ9UGL1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
KDM5BQ9UGL1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
KDM5BQ9UGL1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
KDM5BQ9UGL1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
KDM5BQ9UGL1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
KDM5BQ9UGL1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
KDM5BQ9UGL1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
KDM5BQ9UGL1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
KDM5BQ9UGL1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
KDM5BQ9UGL1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
KDM5BQ9UGL1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
KDM5BQ9UGL1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
KDM5BQ9UGL1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
KDM5BQ9UGL1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
KDM5BQ9UGL1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC39.88■■■■□ 3.97
KDM5BQ9UGL1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
KDM5BQ9UGL1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
KDM5BQ9UGL1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
KDM5BQ9UGL1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
KDM5BQ9UGL1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
KDM5BQ9UGL1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
KDM5BQ9UGL1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
KDM5BQ9UGL1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
KDM5BQ9UGL1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
KDM5BQ9UGL1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
KDM5BQ9UGL1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC39.86■■■■□ 3.97
KDM5BQ9UGL1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC39.86■■■■□ 3.97
KDM5BQ9UGL1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC39.86■■■■□ 3.97
KDM5BQ9UGL1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC39.85■■■■□ 3.97
KDM5BQ9UGL1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC39.85■■■■□ 3.97
KDM5BQ9UGL1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC39.85■■■■□ 3.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms