Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY6

TRIM10, Tripartite motif-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM10Q9UDY6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM10Q9UDY6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM10Q9UDY6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM10Q9UDY6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM10Q9UDY6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM10Q9UDY6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM10Q9UDY6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM10Q9UDY6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM10Q9UDY6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM10Q9UDY6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM10Q9UDY6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM10Q9UDY6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM10Q9UDY6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM10Q9UDY6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM10Q9UDY6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM10Q9UDY6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM10Q9UDY6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM10Q9UDY6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM10Q9UDY6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM10Q9UDY6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM10Q9UDY6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM10Q9UDY6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM10Q9UDY6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM10Q9UDY6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM10Q9UDY6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM10Q9UDY6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM10Q9UDY6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM10Q9UDY6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM10Q9UDY6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM10Q9UDY6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM10Q9UDY6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM10Q9UDY6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM10Q9UDY6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM10Q9UDY6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM10Q9UDY6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM10Q9UDY6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM10Q9UDY6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM10Q9UDY6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM10Q9UDY6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM10Q9UDY6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM10Q9UDY6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM10Q9UDY6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM10Q9UDY6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM10Q9UDY6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM10Q9UDY6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM10Q9UDY6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM10Q9UDY6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM10Q9UDY6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM10Q9UDY6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM10Q9UDY6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM10Q9UDY6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM10Q9UDY6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM10Q9UDY6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM10Q9UDY6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM10Q9UDY6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM10Q9UDY6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM10Q9UDY6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM10Q9UDY6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM10Q9UDY6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM10Q9UDY6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM10Q9UDY6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM10Q9UDY6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM10Q9UDY6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM10Q9UDY6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM10Q9UDY6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM10Q9UDY6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM10Q9UDY6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM10Q9UDY6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM10Q9UDY6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM10Q9UDY6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM10Q9UDY6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM10Q9UDY6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM10Q9UDY6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM10Q9UDY6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM10Q9UDY6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM10Q9UDY6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM10Q9UDY6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM10Q9UDY6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM10Q9UDY6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM10Q9UDY6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM10Q9UDY6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM10Q9UDY6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM10Q9UDY6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM10Q9UDY6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM10Q9UDY6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM10Q9UDY6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM10Q9UDY6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM10Q9UDY6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM10Q9UDY6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM10Q9UDY6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM10Q9UDY6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM10Q9UDY6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM10Q9UDY6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM10Q9UDY6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM10Q9UDY6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM10Q9UDY6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM10Q9UDY6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM10Q9UDY6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM10Q9UDY6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM10Q9UDY6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms