Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL13Q9P2N7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL13Q9P2N7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL13Q9P2N7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL13Q9P2N7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL13Q9P2N7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL13Q9P2N7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL13Q9P2N7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL13Q9P2N7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL13Q9P2N7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL13Q9P2N7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL13Q9P2N7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL13Q9P2N7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL13Q9P2N7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL13Q9P2N7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL13Q9P2N7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL13Q9P2N7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL13Q9P2N7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL13Q9P2N7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL13Q9P2N7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL13Q9P2N7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHL13Q9P2N7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHL13Q9P2N7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHL13Q9P2N7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHL13Q9P2N7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL13Q9P2N7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL13Q9P2N7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL13Q9P2N7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL13Q9P2N7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL13Q9P2N7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL13Q9P2N7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL13Q9P2N7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL13Q9P2N7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL13Q9P2N7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL13Q9P2N7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL13Q9P2N7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL13Q9P2N7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL13Q9P2N7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL13Q9P2N7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL13Q9P2N7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL13Q9P2N7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL13Q9P2N7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL13Q9P2N7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL13Q9P2N7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL13Q9P2N7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL13Q9P2N7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL13Q9P2N7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL13Q9P2N7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL13Q9P2N7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL13Q9P2N7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL13Q9P2N7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL13Q9P2N7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL13Q9P2N7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL13Q9P2N7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLHL13Q9P2N7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL13Q9P2N7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL13Q9P2N7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL13Q9P2N7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL13Q9P2N7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL13Q9P2N7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL13Q9P2N7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL13Q9P2N7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL13Q9P2N7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL13Q9P2N7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL13Q9P2N7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL13Q9P2N7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL13Q9P2N7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL13Q9P2N7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL13Q9P2N7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL13Q9P2N7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL13Q9P2N7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL13Q9P2N7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL13Q9P2N7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL13Q9P2N7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL13Q9P2N7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL13Q9P2N7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL13Q9P2N7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL13Q9P2N7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL13Q9P2N7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL13Q9P2N7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL13Q9P2N7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KLHL13Q9P2N7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL13Q9P2N7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL13Q9P2N7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL13Q9P2N7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL13Q9P2N7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL13Q9P2N7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL13Q9P2N7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL13Q9P2N7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL13Q9P2N7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL13Q9P2N7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL13Q9P2N7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL13Q9P2N7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL13Q9P2N7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL13Q9P2N7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL13Q9P2N7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL13Q9P2N7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL13Q9P2N7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL13Q9P2N7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL13Q9P2N7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms