Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC88CQ9P219 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC88CQ9P219 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC88CQ9P219 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC88CQ9P219 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC88CQ9P219 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC88CQ9P219 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC88CQ9P219 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC88CQ9P219 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC88CQ9P219 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC88CQ9P219 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC88CQ9P219 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC88CQ9P219 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC88CQ9P219 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC88CQ9P219 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC88CQ9P219 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC88CQ9P219 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC88CQ9P219 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC88CQ9P219 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC88CQ9P219 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC88CQ9P219 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC88CQ9P219 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC88CQ9P219 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC88CQ9P219 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC88CQ9P219 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC88CQ9P219 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC88CQ9P219 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC88CQ9P219 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC88CQ9P219 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC88CQ9P219 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC88CQ9P219 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC88CQ9P219 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC88CQ9P219 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC88CQ9P219 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC88CQ9P219 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC88CQ9P219 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC88CQ9P219 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC88CQ9P219 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC88CQ9P219 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC88CQ9P219 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC88CQ9P219 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC88CQ9P219 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC88CQ9P219 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC88CQ9P219 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC88CQ9P219 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC88CQ9P219 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC88CQ9P219 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC88CQ9P219 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC88CQ9P219 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC88CQ9P219 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC88CQ9P219 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC88CQ9P219 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC88CQ9P219 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC88CQ9P219 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC88CQ9P219 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC88CQ9P219 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC88CQ9P219 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC88CQ9P219 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC88CQ9P219 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC88CQ9P219 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC88CQ9P219 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC88CQ9P219 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC88CQ9P219 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC88CQ9P219 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC88CQ9P219 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC88CQ9P219 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC88CQ9P219 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC88CQ9P219 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC88CQ9P219 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC88CQ9P219 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC88CQ9P219 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC88CQ9P219 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC88CQ9P219 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC88CQ9P219 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC88CQ9P219 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC88CQ9P219 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC88CQ9P219 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC88CQ9P219 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC88CQ9P219 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC88CQ9P219 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC88CQ9P219 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC88CQ9P219 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC88CQ9P219 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC88CQ9P219 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC88CQ9P219 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC88CQ9P219 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC88CQ9P219 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC88CQ9P219 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC88CQ9P219 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC88CQ9P219 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC88CQ9P219 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC88CQ9P219 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC88CQ9P219 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC88CQ9P219 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC88CQ9P219 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC88CQ9P219 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC88CQ9P219 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC88CQ9P219 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC88CQ9P219 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC88CQ9P219 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms