Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0T7

TMEM9, Transmembrane protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM9Q9P0T7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM9Q9P0T7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM9Q9P0T7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM9Q9P0T7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM9Q9P0T7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM9Q9P0T7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM9Q9P0T7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM9Q9P0T7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM9Q9P0T7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM9Q9P0T7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM9Q9P0T7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM9Q9P0T7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM9Q9P0T7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM9Q9P0T7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM9Q9P0T7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM9Q9P0T7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM9Q9P0T7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM9Q9P0T7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM9Q9P0T7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM9Q9P0T7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM9Q9P0T7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM9Q9P0T7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM9Q9P0T7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM9Q9P0T7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM9Q9P0T7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM9Q9P0T7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM9Q9P0T7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM9Q9P0T7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM9Q9P0T7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM9Q9P0T7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM9Q9P0T7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM9Q9P0T7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM9Q9P0T7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM9Q9P0T7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM9Q9P0T7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM9Q9P0T7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM9Q9P0T7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM9Q9P0T7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM9Q9P0T7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM9Q9P0T7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM9Q9P0T7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM9Q9P0T7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM9Q9P0T7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM9Q9P0T7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM9Q9P0T7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM9Q9P0T7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM9Q9P0T7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM9Q9P0T7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM9Q9P0T7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM9Q9P0T7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM9Q9P0T7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM9Q9P0T7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM9Q9P0T7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM9Q9P0T7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM9Q9P0T7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM9Q9P0T7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM9Q9P0T7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM9Q9P0T7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM9Q9P0T7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM9Q9P0T7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM9Q9P0T7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM9Q9P0T7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM9Q9P0T7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM9Q9P0T7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM9Q9P0T7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM9Q9P0T7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM9Q9P0T7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM9Q9P0T7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM9Q9P0T7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM9Q9P0T7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM9Q9P0T7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM9Q9P0T7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM9Q9P0T7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM9Q9P0T7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM9Q9P0T7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM9Q9P0T7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM9Q9P0T7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM9Q9P0T7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM9Q9P0T7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM9Q9P0T7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM9Q9P0T7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM9Q9P0T7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM9Q9P0T7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM9Q9P0T7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM9Q9P0T7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM9Q9P0T7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM9Q9P0T7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM9Q9P0T7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM9Q9P0T7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM9Q9P0T7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM9Q9P0T7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM9Q9P0T7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM9Q9P0T7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM9Q9P0T7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM9Q9P0T7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM9Q9P0T7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM9Q9P0T7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM9Q9P0T7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM9Q9P0T7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM9Q9P0T7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms