Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDP1Q9P0J1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDP1Q9P0J1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDP1Q9P0J1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDP1Q9P0J1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PDP1Q9P0J1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDP1Q9P0J1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDP1Q9P0J1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDP1Q9P0J1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDP1Q9P0J1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDP1Q9P0J1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDP1Q9P0J1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDP1Q9P0J1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDP1Q9P0J1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDP1Q9P0J1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDP1Q9P0J1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDP1Q9P0J1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDP1Q9P0J1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDP1Q9P0J1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDP1Q9P0J1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDP1Q9P0J1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDP1Q9P0J1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDP1Q9P0J1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDP1Q9P0J1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PDP1Q9P0J1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDP1Q9P0J1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDP1Q9P0J1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDP1Q9P0J1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDP1Q9P0J1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDP1Q9P0J1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PDP1Q9P0J1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDP1Q9P0J1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDP1Q9P0J1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDP1Q9P0J1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDP1Q9P0J1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDP1Q9P0J1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDP1Q9P0J1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDP1Q9P0J1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDP1Q9P0J1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDP1Q9P0J1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDP1Q9P0J1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDP1Q9P0J1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDP1Q9P0J1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDP1Q9P0J1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDP1Q9P0J1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDP1Q9P0J1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDP1Q9P0J1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDP1Q9P0J1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDP1Q9P0J1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDP1Q9P0J1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDP1Q9P0J1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDP1Q9P0J1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDP1Q9P0J1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDP1Q9P0J1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDP1Q9P0J1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDP1Q9P0J1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDP1Q9P0J1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDP1Q9P0J1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDP1Q9P0J1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDP1Q9P0J1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PDP1Q9P0J1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDP1Q9P0J1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDP1Q9P0J1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDP1Q9P0J1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDP1Q9P0J1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDP1Q9P0J1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDP1Q9P0J1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDP1Q9P0J1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDP1Q9P0J1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDP1Q9P0J1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDP1Q9P0J1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDP1Q9P0J1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDP1Q9P0J1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDP1Q9P0J1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDP1Q9P0J1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDP1Q9P0J1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDP1Q9P0J1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDP1Q9P0J1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDP1Q9P0J1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDP1Q9P0J1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDP1Q9P0J1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDP1Q9P0J1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDP1Q9P0J1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDP1Q9P0J1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDP1Q9P0J1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDP1Q9P0J1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDP1Q9P0J1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PDP1Q9P0J1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDP1Q9P0J1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDP1Q9P0J1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDP1Q9P0J1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDP1Q9P0J1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDP1Q9P0J1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDP1Q9P0J1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDP1Q9P0J1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDP1Q9P0J1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PDP1Q9P0J1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDP1Q9P0J1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDP1Q9P0J1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PDP1Q9P0J1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms