Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EHD3Q9NZN3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
EHD3Q9NZN3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EHD3Q9NZN3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EHD3Q9NZN3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EHD3Q9NZN3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EHD3Q9NZN3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EHD3Q9NZN3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EHD3Q9NZN3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EHD3Q9NZN3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EHD3Q9NZN3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
EHD3Q9NZN3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EHD3Q9NZN3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EHD3Q9NZN3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
EHD3Q9NZN3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
EHD3Q9NZN3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EHD3Q9NZN3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EHD3Q9NZN3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EHD3Q9NZN3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EHD3Q9NZN3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EHD3Q9NZN3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EHD3Q9NZN3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EHD3Q9NZN3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EHD3Q9NZN3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EHD3Q9NZN3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EHD3Q9NZN3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EHD3Q9NZN3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EHD3Q9NZN3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EHD3Q9NZN3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EHD3Q9NZN3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EHD3Q9NZN3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EHD3Q9NZN3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EHD3Q9NZN3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EHD3Q9NZN3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EHD3Q9NZN3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
EHD3Q9NZN3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EHD3Q9NZN3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EHD3Q9NZN3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EHD3Q9NZN3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EHD3Q9NZN3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EHD3Q9NZN3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EHD3Q9NZN3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EHD3Q9NZN3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EHD3Q9NZN3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EHD3Q9NZN3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EHD3Q9NZN3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EHD3Q9NZN3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EHD3Q9NZN3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EHD3Q9NZN3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EHD3Q9NZN3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EHD3Q9NZN3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
EHD3Q9NZN3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EHD3Q9NZN3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EHD3Q9NZN3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EHD3Q9NZN3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EHD3Q9NZN3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EHD3Q9NZN3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EHD3Q9NZN3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EHD3Q9NZN3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EHD3Q9NZN3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EHD3Q9NZN3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EHD3Q9NZN3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EHD3Q9NZN3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EHD3Q9NZN3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EHD3Q9NZN3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EHD3Q9NZN3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EHD3Q9NZN3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EHD3Q9NZN3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EHD3Q9NZN3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EHD3Q9NZN3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EHD3Q9NZN3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EHD3Q9NZN3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EHD3Q9NZN3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EHD3Q9NZN3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EHD3Q9NZN3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EHD3Q9NZN3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EHD3Q9NZN3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
EHD3Q9NZN3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
EHD3Q9NZN3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
EHD3Q9NZN3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
EHD3Q9NZN3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
EHD3Q9NZN3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
EHD3Q9NZN3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
EHD3Q9NZN3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
EHD3Q9NZN3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
EHD3Q9NZN3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EHD3Q9NZN3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EHD3Q9NZN3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EHD3Q9NZN3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EHD3Q9NZN3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EHD3Q9NZN3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EHD3Q9NZN3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EHD3Q9NZN3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EHD3Q9NZN3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EHD3Q9NZN3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EHD3Q9NZN3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EHD3Q9NZN3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EHD3Q9NZN3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EHD3Q9NZN3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EHD3Q9NZN3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms