Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ43

USE1, Vesicle transport protein USE1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USE1Q9NZ43 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USE1Q9NZ43 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USE1Q9NZ43 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USE1Q9NZ43 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USE1Q9NZ43 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USE1Q9NZ43 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USE1Q9NZ43 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USE1Q9NZ43 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USE1Q9NZ43 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USE1Q9NZ43 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USE1Q9NZ43 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USE1Q9NZ43 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USE1Q9NZ43 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USE1Q9NZ43 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USE1Q9NZ43 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USE1Q9NZ43 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USE1Q9NZ43 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USE1Q9NZ43 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USE1Q9NZ43 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USE1Q9NZ43 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
USE1Q9NZ43 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USE1Q9NZ43 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USE1Q9NZ43 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USE1Q9NZ43 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USE1Q9NZ43 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USE1Q9NZ43 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USE1Q9NZ43 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USE1Q9NZ43 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USE1Q9NZ43 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USE1Q9NZ43 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USE1Q9NZ43 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USE1Q9NZ43 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USE1Q9NZ43 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USE1Q9NZ43 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USE1Q9NZ43 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USE1Q9NZ43 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USE1Q9NZ43 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USE1Q9NZ43 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USE1Q9NZ43 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USE1Q9NZ43 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USE1Q9NZ43 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USE1Q9NZ43 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USE1Q9NZ43 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USE1Q9NZ43 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USE1Q9NZ43 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USE1Q9NZ43 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USE1Q9NZ43 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USE1Q9NZ43 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USE1Q9NZ43 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USE1Q9NZ43 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USE1Q9NZ43 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USE1Q9NZ43 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USE1Q9NZ43 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USE1Q9NZ43 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
USE1Q9NZ43 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USE1Q9NZ43 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USE1Q9NZ43 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USE1Q9NZ43 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USE1Q9NZ43 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USE1Q9NZ43 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USE1Q9NZ43 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USE1Q9NZ43 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USE1Q9NZ43 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USE1Q9NZ43 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USE1Q9NZ43 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USE1Q9NZ43 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USE1Q9NZ43 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
USE1Q9NZ43 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USE1Q9NZ43 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USE1Q9NZ43 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USE1Q9NZ43 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USE1Q9NZ43 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USE1Q9NZ43 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USE1Q9NZ43 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USE1Q9NZ43 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USE1Q9NZ43 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USE1Q9NZ43 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USE1Q9NZ43 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USE1Q9NZ43 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USE1Q9NZ43 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
USE1Q9NZ43 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USE1Q9NZ43 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USE1Q9NZ43 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USE1Q9NZ43 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USE1Q9NZ43 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USE1Q9NZ43 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USE1Q9NZ43 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USE1Q9NZ43 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USE1Q9NZ43 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USE1Q9NZ43 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USE1Q9NZ43 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USE1Q9NZ43 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USE1Q9NZ43 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USE1Q9NZ43 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USE1Q9NZ43 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USE1Q9NZ43 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USE1Q9NZ43 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
USE1Q9NZ43 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USE1Q9NZ43 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USE1Q9NZ43 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms