Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RRN3Q9NYV6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RRN3Q9NYV6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RRN3Q9NYV6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RRN3Q9NYV6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RRN3Q9NYV6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RRN3Q9NYV6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RRN3Q9NYV6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RRN3Q9NYV6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RRN3Q9NYV6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RRN3Q9NYV6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RRN3Q9NYV6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RRN3Q9NYV6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RRN3Q9NYV6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RRN3Q9NYV6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RRN3Q9NYV6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRN3Q9NYV6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRN3Q9NYV6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRN3Q9NYV6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRN3Q9NYV6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRN3Q9NYV6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RRN3Q9NYV6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRN3Q9NYV6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRN3Q9NYV6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRN3Q9NYV6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRN3Q9NYV6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRN3Q9NYV6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRN3Q9NYV6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RRN3Q9NYV6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRN3Q9NYV6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RRN3Q9NYV6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRN3Q9NYV6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RRN3Q9NYV6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRN3Q9NYV6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRN3Q9NYV6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRN3Q9NYV6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRN3Q9NYV6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRN3Q9NYV6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRN3Q9NYV6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRN3Q9NYV6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRN3Q9NYV6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRN3Q9NYV6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRN3Q9NYV6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRN3Q9NYV6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRN3Q9NYV6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRN3Q9NYV6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRN3Q9NYV6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRN3Q9NYV6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRN3Q9NYV6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRN3Q9NYV6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRN3Q9NYV6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRN3Q9NYV6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRN3Q9NYV6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRN3Q9NYV6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRN3Q9NYV6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RRN3Q9NYV6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRN3Q9NYV6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRN3Q9NYV6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRN3Q9NYV6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRN3Q9NYV6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRN3Q9NYV6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRN3Q9NYV6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRN3Q9NYV6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRN3Q9NYV6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRN3Q9NYV6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRN3Q9NYV6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRN3Q9NYV6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RRN3Q9NYV6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRN3Q9NYV6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRN3Q9NYV6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRN3Q9NYV6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRN3Q9NYV6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRN3Q9NYV6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRN3Q9NYV6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRN3Q9NYV6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RRN3Q9NYV6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRN3Q9NYV6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRN3Q9NYV6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRN3Q9NYV6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRN3Q9NYV6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRN3Q9NYV6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRN3Q9NYV6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRN3Q9NYV6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RRN3Q9NYV6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRN3Q9NYV6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRN3Q9NYV6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRN3Q9NYV6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRN3Q9NYV6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRN3Q9NYV6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRN3Q9NYV6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRN3Q9NYV6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRN3Q9NYV6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRN3Q9NYV6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRN3Q9NYV6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRN3Q9NYV6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRN3Q9NYV6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRN3Q9NYV6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRN3Q9NYV6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRN3Q9NYV6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RRN3Q9NYV6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms