Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY35

CLDND1, Claudin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND1Q9NY35 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLDND1Q9NY35 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLDND1Q9NY35 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLDND1Q9NY35 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLDND1Q9NY35 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLDND1Q9NY35 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLDND1Q9NY35 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CLDND1Q9NY35 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLDND1Q9NY35 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLDND1Q9NY35 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CLDND1Q9NY35 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLDND1Q9NY35 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLDND1Q9NY35 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLDND1Q9NY35 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLDND1Q9NY35 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLDND1Q9NY35 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLDND1Q9NY35 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLDND1Q9NY35 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLDND1Q9NY35 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLDND1Q9NY35 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLDND1Q9NY35 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLDND1Q9NY35 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLDND1Q9NY35 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CLDND1Q9NY35 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLDND1Q9NY35 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLDND1Q9NY35 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLDND1Q9NY35 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLDND1Q9NY35 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CLDND1Q9NY35 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLDND1Q9NY35 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CLDND1Q9NY35 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLDND1Q9NY35 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLDND1Q9NY35 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLDND1Q9NY35 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLDND1Q9NY35 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CLDND1Q9NY35 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLDND1Q9NY35 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLDND1Q9NY35 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLDND1Q9NY35 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLDND1Q9NY35 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLDND1Q9NY35 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLDND1Q9NY35 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLDND1Q9NY35 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLDND1Q9NY35 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLDND1Q9NY35 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLDND1Q9NY35 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CLDND1Q9NY35 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLDND1Q9NY35 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLDND1Q9NY35 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CLDND1Q9NY35 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLDND1Q9NY35 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLDND1Q9NY35 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLDND1Q9NY35 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLDND1Q9NY35 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLDND1Q9NY35 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLDND1Q9NY35 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLDND1Q9NY35 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CLDND1Q9NY35 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLDND1Q9NY35 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLDND1Q9NY35 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLDND1Q9NY35 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLDND1Q9NY35 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLDND1Q9NY35 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLDND1Q9NY35 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLDND1Q9NY35 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLDND1Q9NY35 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLDND1Q9NY35 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CLDND1Q9NY35 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLDND1Q9NY35 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLDND1Q9NY35 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLDND1Q9NY35 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLDND1Q9NY35 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLDND1Q9NY35 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLDND1Q9NY35 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLDND1Q9NY35 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CLDND1Q9NY35 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLDND1Q9NY35 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLDND1Q9NY35 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLDND1Q9NY35 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLDND1Q9NY35 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLDND1Q9NY35 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CLDND1Q9NY35 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLDND1Q9NY35 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLDND1Q9NY35 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLDND1Q9NY35 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLDND1Q9NY35 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLDND1Q9NY35 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLDND1Q9NY35 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLDND1Q9NY35 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLDND1Q9NY35 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CLDND1Q9NY35 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CLDND1Q9NY35 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CLDND1Q9NY35 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CLDND1Q9NY35 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLDND1Q9NY35 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLDND1Q9NY35 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLDND1Q9NY35 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLDND1Q9NY35 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLDND1Q9NY35 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLDND1Q9NY35 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms