Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX95

SYBU, Syntabulin, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYBUQ9NX95 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SYBUQ9NX95 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYBUQ9NX95 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYBUQ9NX95 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYBUQ9NX95 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYBUQ9NX95 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYBUQ9NX95 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYBUQ9NX95 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYBUQ9NX95 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYBUQ9NX95 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYBUQ9NX95 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYBUQ9NX95 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYBUQ9NX95 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYBUQ9NX95 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYBUQ9NX95 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYBUQ9NX95 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYBUQ9NX95 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYBUQ9NX95 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYBUQ9NX95 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYBUQ9NX95 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYBUQ9NX95 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYBUQ9NX95 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYBUQ9NX95 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SYBUQ9NX95 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYBUQ9NX95 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYBUQ9NX95 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYBUQ9NX95 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SYBUQ9NX95 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYBUQ9NX95 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SYBUQ9NX95 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYBUQ9NX95 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYBUQ9NX95 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYBUQ9NX95 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYBUQ9NX95 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYBUQ9NX95 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYBUQ9NX95 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYBUQ9NX95 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYBUQ9NX95 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYBUQ9NX95 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYBUQ9NX95 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYBUQ9NX95 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYBUQ9NX95 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYBUQ9NX95 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYBUQ9NX95 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYBUQ9NX95 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYBUQ9NX95 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYBUQ9NX95 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYBUQ9NX95 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYBUQ9NX95 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYBUQ9NX95 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYBUQ9NX95 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYBUQ9NX95 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYBUQ9NX95 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYBUQ9NX95 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYBUQ9NX95 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYBUQ9NX95 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYBUQ9NX95 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYBUQ9NX95 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYBUQ9NX95 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYBUQ9NX95 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYBUQ9NX95 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYBUQ9NX95 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYBUQ9NX95 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYBUQ9NX95 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYBUQ9NX95 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYBUQ9NX95 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYBUQ9NX95 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYBUQ9NX95 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYBUQ9NX95 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYBUQ9NX95 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYBUQ9NX95 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYBUQ9NX95 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYBUQ9NX95 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYBUQ9NX95 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYBUQ9NX95 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYBUQ9NX95 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYBUQ9NX95 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYBUQ9NX95 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYBUQ9NX95 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYBUQ9NX95 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYBUQ9NX95 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYBUQ9NX95 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYBUQ9NX95 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYBUQ9NX95 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYBUQ9NX95 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYBUQ9NX95 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYBUQ9NX95 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYBUQ9NX95 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYBUQ9NX95 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYBUQ9NX95 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYBUQ9NX95 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYBUQ9NX95 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYBUQ9NX95 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYBUQ9NX95 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYBUQ9NX95 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYBUQ9NX95 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYBUQ9NX95 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYBUQ9NX95 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYBUQ9NX95 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYBUQ9NX95 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms