Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
DDIT4Q9NX09 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
DDIT4Q9NX09 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDIT4Q9NX09 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDIT4Q9NX09 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDIT4Q9NX09 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
DDIT4Q9NX09 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDIT4Q9NX09 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDIT4Q9NX09 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDIT4Q9NX09 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDIT4Q9NX09 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDIT4Q9NX09 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDIT4Q9NX09 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDIT4Q9NX09 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDIT4Q9NX09 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDIT4Q9NX09 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDIT4Q9NX09 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDIT4Q9NX09 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDIT4Q9NX09 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDIT4Q9NX09 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDIT4Q9NX09 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDIT4Q9NX09 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDIT4Q9NX09 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDIT4Q9NX09 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDIT4Q9NX09 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
DDIT4Q9NX09 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDIT4Q9NX09 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDIT4Q9NX09 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDIT4Q9NX09 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDIT4Q9NX09 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDIT4Q9NX09 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDIT4Q9NX09 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDIT4Q9NX09 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDIT4Q9NX09 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDIT4Q9NX09 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDIT4Q9NX09 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDIT4Q9NX09 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDIT4Q9NX09 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDIT4Q9NX09 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDIT4Q9NX09 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDIT4Q9NX09 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDIT4Q9NX09 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDIT4Q9NX09 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDIT4Q9NX09 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
DDIT4Q9NX09 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDIT4Q9NX09 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDIT4Q9NX09 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
DDIT4Q9NX09 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDIT4Q9NX09 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDIT4Q9NX09 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDIT4Q9NX09 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDIT4Q9NX09 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
DDIT4Q9NX09 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDIT4Q9NX09 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDIT4Q9NX09 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDIT4Q9NX09 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDIT4Q9NX09 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DDIT4Q9NX09 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDIT4Q9NX09 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDIT4Q9NX09 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDIT4Q9NX09 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDIT4Q9NX09 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDIT4Q9NX09 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDIT4Q9NX09 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDIT4Q9NX09 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDIT4Q9NX09 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DDIT4Q9NX09 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDIT4Q9NX09 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDIT4Q9NX09 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
DDIT4Q9NX09 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDIT4Q9NX09 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDIT4Q9NX09 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDIT4Q9NX09 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDIT4Q9NX09 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDIT4Q9NX09 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDIT4Q9NX09 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDIT4Q9NX09 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDIT4Q9NX09 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDIT4Q9NX09 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDIT4Q9NX09 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDIT4Q9NX09 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDIT4Q9NX09 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDIT4Q9NX09 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDIT4Q9NX09 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDIT4Q9NX09 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDIT4Q9NX09 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDIT4Q9NX09 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDIT4Q9NX09 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDIT4Q9NX09 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDIT4Q9NX09 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDIT4Q9NX09 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDIT4Q9NX09 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDIT4Q9NX09 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
DDIT4Q9NX09 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDIT4Q9NX09 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDIT4Q9NX09 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDIT4Q9NX09 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDIT4Q9NX09 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDIT4Q9NX09 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDIT4Q9NX09 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms