Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWS1

PARPBP, PCNA-interacting partner, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARPBPQ9NWS1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARPBPQ9NWS1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARPBPQ9NWS1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARPBPQ9NWS1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARPBPQ9NWS1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARPBPQ9NWS1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARPBPQ9NWS1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARPBPQ9NWS1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PARPBPQ9NWS1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARPBPQ9NWS1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARPBPQ9NWS1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARPBPQ9NWS1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARPBPQ9NWS1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARPBPQ9NWS1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARPBPQ9NWS1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARPBPQ9NWS1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARPBPQ9NWS1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARPBPQ9NWS1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PARPBPQ9NWS1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PARPBPQ9NWS1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PARPBPQ9NWS1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARPBPQ9NWS1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARPBPQ9NWS1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARPBPQ9NWS1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARPBPQ9NWS1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARPBPQ9NWS1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARPBPQ9NWS1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARPBPQ9NWS1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARPBPQ9NWS1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARPBPQ9NWS1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARPBPQ9NWS1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARPBPQ9NWS1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARPBPQ9NWS1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARPBPQ9NWS1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARPBPQ9NWS1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARPBPQ9NWS1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PARPBPQ9NWS1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PARPBPQ9NWS1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PARPBPQ9NWS1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PARPBPQ9NWS1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PARPBPQ9NWS1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PARPBPQ9NWS1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARPBPQ9NWS1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARPBPQ9NWS1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARPBPQ9NWS1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARPBPQ9NWS1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARPBPQ9NWS1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PARPBPQ9NWS1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARPBPQ9NWS1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARPBPQ9NWS1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARPBPQ9NWS1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PARPBPQ9NWS1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PARPBPQ9NWS1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PARPBPQ9NWS1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PARPBPQ9NWS1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PARPBPQ9NWS1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PARPBPQ9NWS1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARPBPQ9NWS1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARPBPQ9NWS1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARPBPQ9NWS1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARPBPQ9NWS1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARPBPQ9NWS1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARPBPQ9NWS1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARPBPQ9NWS1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARPBPQ9NWS1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARPBPQ9NWS1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARPBPQ9NWS1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARPBPQ9NWS1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARPBPQ9NWS1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARPBPQ9NWS1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARPBPQ9NWS1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARPBPQ9NWS1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PARPBPQ9NWS1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PARPBPQ9NWS1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARPBPQ9NWS1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PARPBPQ9NWS1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARPBPQ9NWS1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARPBPQ9NWS1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARPBPQ9NWS1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARPBPQ9NWS1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARPBPQ9NWS1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARPBPQ9NWS1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARPBPQ9NWS1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARPBPQ9NWS1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARPBPQ9NWS1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARPBPQ9NWS1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARPBPQ9NWS1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARPBPQ9NWS1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARPBPQ9NWS1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARPBPQ9NWS1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARPBPQ9NWS1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARPBPQ9NWS1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARPBPQ9NWS1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARPBPQ9NWS1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARPBPQ9NWS1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARPBPQ9NWS1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARPBPQ9NWS1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARPBPQ9NWS1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARPBPQ9NWS1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARPBPQ9NWS1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms