Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP1

DDX18, ATP-dependent RNA helicase DDX18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX18Q9NVP1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX18Q9NVP1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX18Q9NVP1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX18Q9NVP1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX18Q9NVP1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX18Q9NVP1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX18Q9NVP1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX18Q9NVP1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX18Q9NVP1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX18Q9NVP1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX18Q9NVP1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX18Q9NVP1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX18Q9NVP1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX18Q9NVP1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX18Q9NVP1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX18Q9NVP1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX18Q9NVP1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX18Q9NVP1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX18Q9NVP1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX18Q9NVP1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX18Q9NVP1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX18Q9NVP1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX18Q9NVP1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX18Q9NVP1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX18Q9NVP1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX18Q9NVP1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX18Q9NVP1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX18Q9NVP1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX18Q9NVP1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX18Q9NVP1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX18Q9NVP1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX18Q9NVP1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX18Q9NVP1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX18Q9NVP1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX18Q9NVP1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX18Q9NVP1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX18Q9NVP1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX18Q9NVP1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX18Q9NVP1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX18Q9NVP1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX18Q9NVP1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX18Q9NVP1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX18Q9NVP1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX18Q9NVP1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX18Q9NVP1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX18Q9NVP1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX18Q9NVP1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX18Q9NVP1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX18Q9NVP1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX18Q9NVP1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX18Q9NVP1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX18Q9NVP1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX18Q9NVP1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX18Q9NVP1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX18Q9NVP1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX18Q9NVP1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDX18Q9NVP1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDX18Q9NVP1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDX18Q9NVP1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDX18Q9NVP1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDX18Q9NVP1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX18Q9NVP1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX18Q9NVP1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX18Q9NVP1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX18Q9NVP1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX18Q9NVP1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX18Q9NVP1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX18Q9NVP1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX18Q9NVP1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX18Q9NVP1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX18Q9NVP1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX18Q9NVP1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX18Q9NVP1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX18Q9NVP1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX18Q9NVP1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX18Q9NVP1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX18Q9NVP1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX18Q9NVP1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX18Q9NVP1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX18Q9NVP1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX18Q9NVP1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX18Q9NVP1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX18Q9NVP1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX18Q9NVP1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX18Q9NVP1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX18Q9NVP1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX18Q9NVP1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX18Q9NVP1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX18Q9NVP1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX18Q9NVP1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX18Q9NVP1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX18Q9NVP1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX18Q9NVP1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX18Q9NVP1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX18Q9NVP1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX18Q9NVP1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
DDX18Q9NVP1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX18Q9NVP1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX18Q9NVP1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX18Q9NVP1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms