Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATAD3AQ9NVI7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATAD3AQ9NVI7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATAD3AQ9NVI7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATAD3AQ9NVI7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATAD3AQ9NVI7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATAD3AQ9NVI7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATAD3AQ9NVI7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATAD3AQ9NVI7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATAD3AQ9NVI7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATAD3AQ9NVI7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATAD3AQ9NVI7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATAD3AQ9NVI7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATAD3AQ9NVI7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATAD3AQ9NVI7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATAD3AQ9NVI7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATAD3AQ9NVI7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATAD3AQ9NVI7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATAD3AQ9NVI7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATAD3AQ9NVI7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATAD3AQ9NVI7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATAD3AQ9NVI7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATAD3AQ9NVI7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATAD3AQ9NVI7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATAD3AQ9NVI7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATAD3AQ9NVI7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATAD3AQ9NVI7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATAD3AQ9NVI7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATAD3AQ9NVI7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATAD3AQ9NVI7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATAD3AQ9NVI7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATAD3AQ9NVI7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATAD3AQ9NVI7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATAD3AQ9NVI7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATAD3AQ9NVI7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATAD3AQ9NVI7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATAD3AQ9NVI7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATAD3AQ9NVI7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATAD3AQ9NVI7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATAD3AQ9NVI7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATAD3AQ9NVI7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATAD3AQ9NVI7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATAD3AQ9NVI7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATAD3AQ9NVI7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATAD3AQ9NVI7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATAD3AQ9NVI7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATAD3AQ9NVI7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATAD3AQ9NVI7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATAD3AQ9NVI7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATAD3AQ9NVI7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATAD3AQ9NVI7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATAD3AQ9NVI7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATAD3AQ9NVI7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATAD3AQ9NVI7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATAD3AQ9NVI7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATAD3AQ9NVI7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATAD3AQ9NVI7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATAD3AQ9NVI7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATAD3AQ9NVI7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATAD3AQ9NVI7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATAD3AQ9NVI7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATAD3AQ9NVI7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATAD3AQ9NVI7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATAD3AQ9NVI7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATAD3AQ9NVI7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATAD3AQ9NVI7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATAD3AQ9NVI7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATAD3AQ9NVI7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATAD3AQ9NVI7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATAD3AQ9NVI7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATAD3AQ9NVI7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ATAD3AQ9NVI7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATAD3AQ9NVI7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATAD3AQ9NVI7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATAD3AQ9NVI7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATAD3AQ9NVI7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATAD3AQ9NVI7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATAD3AQ9NVI7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATAD3AQ9NVI7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATAD3AQ9NVI7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ATAD3AQ9NVI7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATAD3AQ9NVI7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATAD3AQ9NVI7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ATAD3AQ9NVI7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATAD3AQ9NVI7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATAD3AQ9NVI7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATAD3AQ9NVI7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATAD3AQ9NVI7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATAD3AQ9NVI7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATAD3AQ9NVI7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATAD3AQ9NVI7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATAD3AQ9NVI7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATAD3AQ9NVI7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATAD3AQ9NVI7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATAD3AQ9NVI7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATAD3AQ9NVI7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATAD3AQ9NVI7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATAD3AQ9NVI7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATAD3AQ9NVI7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATAD3AQ9NVI7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms