Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH1

DNAJC11, DnaJ homolog subfamily C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC11Q9NVH1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNAJC11Q9NVH1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNAJC11Q9NVH1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNAJC11Q9NVH1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNAJC11Q9NVH1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNAJC11Q9NVH1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNAJC11Q9NVH1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNAJC11Q9NVH1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DNAJC11Q9NVH1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DNAJC11Q9NVH1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DNAJC11Q9NVH1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DNAJC11Q9NVH1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNAJC11Q9NVH1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAJC11Q9NVH1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAJC11Q9NVH1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAJC11Q9NVH1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAJC11Q9NVH1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAJC11Q9NVH1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAJC11Q9NVH1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAJC11Q9NVH1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAJC11Q9NVH1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAJC11Q9NVH1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAJC11Q9NVH1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAJC11Q9NVH1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAJC11Q9NVH1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAJC11Q9NVH1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAJC11Q9NVH1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAJC11Q9NVH1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAJC11Q9NVH1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAJC11Q9NVH1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAJC11Q9NVH1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAJC11Q9NVH1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAJC11Q9NVH1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAJC11Q9NVH1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAJC11Q9NVH1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAJC11Q9NVH1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAJC11Q9NVH1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAJC11Q9NVH1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAJC11Q9NVH1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAJC11Q9NVH1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DNAJC11Q9NVH1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DNAJC11Q9NVH1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJC11Q9NVH1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJC11Q9NVH1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJC11Q9NVH1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJC11Q9NVH1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJC11Q9NVH1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJC11Q9NVH1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJC11Q9NVH1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJC11Q9NVH1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJC11Q9NVH1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJC11Q9NVH1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJC11Q9NVH1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJC11Q9NVH1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJC11Q9NVH1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJC11Q9NVH1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJC11Q9NVH1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAJC11Q9NVH1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAJC11Q9NVH1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAJC11Q9NVH1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAJC11Q9NVH1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAJC11Q9NVH1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAJC11Q9NVH1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAJC11Q9NVH1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAJC11Q9NVH1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAJC11Q9NVH1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAJC11Q9NVH1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAJC11Q9NVH1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAJC11Q9NVH1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAJC11Q9NVH1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAJC11Q9NVH1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAJC11Q9NVH1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAJC11Q9NVH1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAJC11Q9NVH1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAJC11Q9NVH1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAJC11Q9NVH1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAJC11Q9NVH1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAJC11Q9NVH1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAJC11Q9NVH1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAJC11Q9NVH1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAJC11Q9NVH1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAJC11Q9NVH1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAJC11Q9NVH1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAJC11Q9NVH1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAJC11Q9NVH1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAJC11Q9NVH1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAJC11Q9NVH1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAJC11Q9NVH1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAJC11Q9NVH1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAJC11Q9NVH1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAJC11Q9NVH1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAJC11Q9NVH1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAJC11Q9NVH1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAJC11Q9NVH1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAJC11Q9NVH1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAJC11Q9NVH1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAJC11Q9NVH1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAJC11Q9NVH1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAJC11Q9NVH1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAJC11Q9NVH1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms