Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV58

RNF19A, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19A, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF19AQ9NV58 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RNF19AQ9NV58 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RNF19AQ9NV58 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RNF19AQ9NV58 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RNF19AQ9NV58 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RNF19AQ9NV58 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RNF19AQ9NV58 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RNF19AQ9NV58 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RNF19AQ9NV58 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNF19AQ9NV58 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF19AQ9NV58 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RNF19AQ9NV58 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RNF19AQ9NV58 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RNF19AQ9NV58 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF19AQ9NV58 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RNF19AQ9NV58 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF19AQ9NV58 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF19AQ9NV58 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
RNF19AQ9NV58 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF19AQ9NV58 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF19AQ9NV58 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF19AQ9NV58 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF19AQ9NV58 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF19AQ9NV58 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF19AQ9NV58 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF19AQ9NV58 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF19AQ9NV58 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF19AQ9NV58 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF19AQ9NV58 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF19AQ9NV58 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF19AQ9NV58 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF19AQ9NV58 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF19AQ9NV58 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF19AQ9NV58 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF19AQ9NV58 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF19AQ9NV58 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF19AQ9NV58 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF19AQ9NV58 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF19AQ9NV58 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF19AQ9NV58 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RNF19AQ9NV58 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RNF19AQ9NV58 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RNF19AQ9NV58 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF19AQ9NV58 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF19AQ9NV58 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF19AQ9NV58 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF19AQ9NV58 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF19AQ9NV58 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF19AQ9NV58 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF19AQ9NV58 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF19AQ9NV58 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF19AQ9NV58 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF19AQ9NV58 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF19AQ9NV58 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF19AQ9NV58 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF19AQ9NV58 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF19AQ9NV58 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF19AQ9NV58 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF19AQ9NV58 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF19AQ9NV58 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF19AQ9NV58 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RNF19AQ9NV58 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RNF19AQ9NV58 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RNF19AQ9NV58 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RNF19AQ9NV58 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
RNF19AQ9NV58 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RNF19AQ9NV58 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF19AQ9NV58 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF19AQ9NV58 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF19AQ9NV58 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF19AQ9NV58 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF19AQ9NV58 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF19AQ9NV58 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF19AQ9NV58 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF19AQ9NV58 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF19AQ9NV58 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF19AQ9NV58 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF19AQ9NV58 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF19AQ9NV58 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF19AQ9NV58 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF19AQ9NV58 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF19AQ9NV58 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF19AQ9NV58 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF19AQ9NV58 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF19AQ9NV58 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF19AQ9NV58 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF19AQ9NV58 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF19AQ9NV58 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
RNF19AQ9NV58 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF19AQ9NV58 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF19AQ9NV58 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF19AQ9NV58 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF19AQ9NV58 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF19AQ9NV58 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RNF19AQ9NV58 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF19AQ9NV58 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF19AQ9NV58 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF19AQ9NV58 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF19AQ9NV58 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF19AQ9NV58 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms