Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUP7

TRMT13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT13Q9NUP7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRMT13Q9NUP7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TRMT13Q9NUP7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRMT13Q9NUP7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRMT13Q9NUP7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRMT13Q9NUP7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRMT13Q9NUP7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRMT13Q9NUP7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRMT13Q9NUP7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRMT13Q9NUP7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRMT13Q9NUP7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRMT13Q9NUP7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRMT13Q9NUP7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRMT13Q9NUP7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRMT13Q9NUP7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TRMT13Q9NUP7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRMT13Q9NUP7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TRMT13Q9NUP7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRMT13Q9NUP7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRMT13Q9NUP7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRMT13Q9NUP7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TRMT13Q9NUP7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRMT13Q9NUP7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRMT13Q9NUP7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TRMT13Q9NUP7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRMT13Q9NUP7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRMT13Q9NUP7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRMT13Q9NUP7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRMT13Q9NUP7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRMT13Q9NUP7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TRMT13Q9NUP7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRMT13Q9NUP7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TRMT13Q9NUP7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRMT13Q9NUP7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRMT13Q9NUP7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRMT13Q9NUP7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TRMT13Q9NUP7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRMT13Q9NUP7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TRMT13Q9NUP7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TRMT13Q9NUP7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRMT13Q9NUP7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRMT13Q9NUP7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRMT13Q9NUP7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRMT13Q9NUP7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TRMT13Q9NUP7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRMT13Q9NUP7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRMT13Q9NUP7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRMT13Q9NUP7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRMT13Q9NUP7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRMT13Q9NUP7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRMT13Q9NUP7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRMT13Q9NUP7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRMT13Q9NUP7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRMT13Q9NUP7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRMT13Q9NUP7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRMT13Q9NUP7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRMT13Q9NUP7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRMT13Q9NUP7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRMT13Q9NUP7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRMT13Q9NUP7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRMT13Q9NUP7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRMT13Q9NUP7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRMT13Q9NUP7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRMT13Q9NUP7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
TRMT13Q9NUP7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRMT13Q9NUP7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRMT13Q9NUP7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TRMT13Q9NUP7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TRMT13Q9NUP7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRMT13Q9NUP7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRMT13Q9NUP7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRMT13Q9NUP7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRMT13Q9NUP7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRMT13Q9NUP7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRMT13Q9NUP7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRMT13Q9NUP7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRMT13Q9NUP7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRMT13Q9NUP7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRMT13Q9NUP7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRMT13Q9NUP7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRMT13Q9NUP7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRMT13Q9NUP7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRMT13Q9NUP7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRMT13Q9NUP7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRMT13Q9NUP7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRMT13Q9NUP7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRMT13Q9NUP7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRMT13Q9NUP7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRMT13Q9NUP7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRMT13Q9NUP7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRMT13Q9NUP7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRMT13Q9NUP7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TRMT13Q9NUP7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRMT13Q9NUP7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRMT13Q9NUP7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRMT13Q9NUP7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRMT13Q9NUP7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRMT13Q9NUP7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRMT13Q9NUP7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRMT13Q9NUP7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms