Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SAMSN1Q9NSI8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SAMSN1Q9NSI8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SAMSN1Q9NSI8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SAMSN1Q9NSI8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SAMSN1Q9NSI8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SAMSN1Q9NSI8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SAMSN1Q9NSI8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SAMSN1Q9NSI8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SAMSN1Q9NSI8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SAMSN1Q9NSI8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SAMSN1Q9NSI8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SAMSN1Q9NSI8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SAMSN1Q9NSI8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SAMSN1Q9NSI8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SAMSN1Q9NSI8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SAMSN1Q9NSI8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SAMSN1Q9NSI8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SAMSN1Q9NSI8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SAMSN1Q9NSI8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SAMSN1Q9NSI8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SAMSN1Q9NSI8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SAMSN1Q9NSI8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SAMSN1Q9NSI8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SAMSN1Q9NSI8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SAMSN1Q9NSI8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SAMSN1Q9NSI8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SAMSN1Q9NSI8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SAMSN1Q9NSI8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SAMSN1Q9NSI8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SAMSN1Q9NSI8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SAMSN1Q9NSI8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SAMSN1Q9NSI8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SAMSN1Q9NSI8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SAMSN1Q9NSI8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SAMSN1Q9NSI8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SAMSN1Q9NSI8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SAMSN1Q9NSI8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SAMSN1Q9NSI8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SAMSN1Q9NSI8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SAMSN1Q9NSI8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SAMSN1Q9NSI8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SAMSN1Q9NSI8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SAMSN1Q9NSI8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SAMSN1Q9NSI8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SAMSN1Q9NSI8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SAMSN1Q9NSI8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SAMSN1Q9NSI8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SAMSN1Q9NSI8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SAMSN1Q9NSI8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SAMSN1Q9NSI8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SAMSN1Q9NSI8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SAMSN1Q9NSI8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SAMSN1Q9NSI8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SAMSN1Q9NSI8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SAMSN1Q9NSI8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SAMSN1Q9NSI8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SAMSN1Q9NSI8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SAMSN1Q9NSI8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SAMSN1Q9NSI8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SAMSN1Q9NSI8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SAMSN1Q9NSI8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SAMSN1Q9NSI8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SAMSN1Q9NSI8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SAMSN1Q9NSI8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SAMSN1Q9NSI8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SAMSN1Q9NSI8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SAMSN1Q9NSI8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SAMSN1Q9NSI8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SAMSN1Q9NSI8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SAMSN1Q9NSI8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SAMSN1Q9NSI8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SAMSN1Q9NSI8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SAMSN1Q9NSI8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
SAMSN1Q9NSI8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SAMSN1Q9NSI8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SAMSN1Q9NSI8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SAMSN1Q9NSI8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SAMSN1Q9NSI8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SAMSN1Q9NSI8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SAMSN1Q9NSI8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SAMSN1Q9NSI8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SAMSN1Q9NSI8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SAMSN1Q9NSI8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
SAMSN1Q9NSI8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SAMSN1Q9NSI8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SAMSN1Q9NSI8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SAMSN1Q9NSI8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SAMSN1Q9NSI8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SAMSN1Q9NSI8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SAMSN1Q9NSI8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SAMSN1Q9NSI8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SAMSN1Q9NSI8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SAMSN1Q9NSI8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SAMSN1Q9NSI8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SAMSN1Q9NSI8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SAMSN1Q9NSI8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SAMSN1Q9NSI8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SAMSN1Q9NSI8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SAMSN1Q9NSI8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 241.3 ms