Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC6A13Q9NSD5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC6A13Q9NSD5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC6A13Q9NSD5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC6A13Q9NSD5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC6A13Q9NSD5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC6A13Q9NSD5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC6A13Q9NSD5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC6A13Q9NSD5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC6A13Q9NSD5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC6A13Q9NSD5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC6A13Q9NSD5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC6A13Q9NSD5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC6A13Q9NSD5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC6A13Q9NSD5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC6A13Q9NSD5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC6A13Q9NSD5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC6A13Q9NSD5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC6A13Q9NSD5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC6A13Q9NSD5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC6A13Q9NSD5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC6A13Q9NSD5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC6A13Q9NSD5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC6A13Q9NSD5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC6A13Q9NSD5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC6A13Q9NSD5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC6A13Q9NSD5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC6A13Q9NSD5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC6A13Q9NSD5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC6A13Q9NSD5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC6A13Q9NSD5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC6A13Q9NSD5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC6A13Q9NSD5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC6A13Q9NSD5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC6A13Q9NSD5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC6A13Q9NSD5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC6A13Q9NSD5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC6A13Q9NSD5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC6A13Q9NSD5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC6A13Q9NSD5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC6A13Q9NSD5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC6A13Q9NSD5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC6A13Q9NSD5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC6A13Q9NSD5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC6A13Q9NSD5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC6A13Q9NSD5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC6A13Q9NSD5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC6A13Q9NSD5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC6A13Q9NSD5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC6A13Q9NSD5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC6A13Q9NSD5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC6A13Q9NSD5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC6A13Q9NSD5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC6A13Q9NSD5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC6A13Q9NSD5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC6A13Q9NSD5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC6A13Q9NSD5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC6A13Q9NSD5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC6A13Q9NSD5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC6A13Q9NSD5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC6A13Q9NSD5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC6A13Q9NSD5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC6A13Q9NSD5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC6A13Q9NSD5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC6A13Q9NSD5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC6A13Q9NSD5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC6A13Q9NSD5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC6A13Q9NSD5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC6A13Q9NSD5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC6A13Q9NSD5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC6A13Q9NSD5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC6A13Q9NSD5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC6A13Q9NSD5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC6A13Q9NSD5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC6A13Q9NSD5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC6A13Q9NSD5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC6A13Q9NSD5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC6A13Q9NSD5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC6A13Q9NSD5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC6A13Q9NSD5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC6A13Q9NSD5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC6A13Q9NSD5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC6A13Q9NSD5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC6A13Q9NSD5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC6A13Q9NSD5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC6A13Q9NSD5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC6A13Q9NSD5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC6A13Q9NSD5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC6A13Q9NSD5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC6A13Q9NSD5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC6A13Q9NSD5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC6A13Q9NSD5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC6A13Q9NSD5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC6A13Q9NSD5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC6A13Q9NSD5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC6A13Q9NSD5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC6A13Q9NSD5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC6A13Q9NSD5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC6A13Q9NSD5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC6A13Q9NSD5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms