Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNBIP1Q9NSA3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNBIP1Q9NSA3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNBIP1Q9NSA3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNBIP1Q9NSA3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNBIP1Q9NSA3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNBIP1Q9NSA3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNBIP1Q9NSA3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNBIP1Q9NSA3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNBIP1Q9NSA3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNBIP1Q9NSA3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNBIP1Q9NSA3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNBIP1Q9NSA3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNBIP1Q9NSA3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNBIP1Q9NSA3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNBIP1Q9NSA3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNBIP1Q9NSA3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNBIP1Q9NSA3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNBIP1Q9NSA3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNBIP1Q9NSA3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNBIP1Q9NSA3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNBIP1Q9NSA3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNBIP1Q9NSA3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNBIP1Q9NSA3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNBIP1Q9NSA3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNBIP1Q9NSA3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNBIP1Q9NSA3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNBIP1Q9NSA3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNBIP1Q9NSA3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNBIP1Q9NSA3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNBIP1Q9NSA3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNBIP1Q9NSA3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNBIP1Q9NSA3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNBIP1Q9NSA3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNBIP1Q9NSA3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNBIP1Q9NSA3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNBIP1Q9NSA3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNBIP1Q9NSA3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNBIP1Q9NSA3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNBIP1Q9NSA3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNBIP1Q9NSA3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNBIP1Q9NSA3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNBIP1Q9NSA3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNBIP1Q9NSA3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNBIP1Q9NSA3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNBIP1Q9NSA3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNBIP1Q9NSA3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNBIP1Q9NSA3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNBIP1Q9NSA3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNBIP1Q9NSA3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNBIP1Q9NSA3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNBIP1Q9NSA3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNBIP1Q9NSA3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNBIP1Q9NSA3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNBIP1Q9NSA3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNBIP1Q9NSA3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNBIP1Q9NSA3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNBIP1Q9NSA3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNBIP1Q9NSA3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNBIP1Q9NSA3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNBIP1Q9NSA3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNBIP1Q9NSA3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNBIP1Q9NSA3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNBIP1Q9NSA3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNBIP1Q9NSA3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNBIP1Q9NSA3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNBIP1Q9NSA3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNBIP1Q9NSA3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNBIP1Q9NSA3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNBIP1Q9NSA3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNBIP1Q9NSA3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNBIP1Q9NSA3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNBIP1Q9NSA3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNBIP1Q9NSA3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNBIP1Q9NSA3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTNNBIP1Q9NSA3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTNNBIP1Q9NSA3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNBIP1Q9NSA3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNBIP1Q9NSA3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNBIP1Q9NSA3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNBIP1Q9NSA3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms