Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS23

RASSF1, Ras association domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF1Q9NS23 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RASSF1Q9NS23 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RASSF1Q9NS23 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RASSF1Q9NS23 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RASSF1Q9NS23 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RASSF1Q9NS23 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RASSF1Q9NS23 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RASSF1Q9NS23 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASSF1Q9NS23 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASSF1Q9NS23 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASSF1Q9NS23 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RASSF1Q9NS23 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RASSF1Q9NS23 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASSF1Q9NS23 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASSF1Q9NS23 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASSF1Q9NS23 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASSF1Q9NS23 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RASSF1Q9NS23 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RASSF1Q9NS23 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RASSF1Q9NS23 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RASSF1Q9NS23 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RASSF1Q9NS23 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RASSF1Q9NS23 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RASSF1Q9NS23 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RASSF1Q9NS23 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASSF1Q9NS23 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASSF1Q9NS23 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASSF1Q9NS23 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASSF1Q9NS23 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASSF1Q9NS23 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASSF1Q9NS23 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASSF1Q9NS23 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASSF1Q9NS23 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASSF1Q9NS23 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASSF1Q9NS23 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASSF1Q9NS23 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASSF1Q9NS23 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms