Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS45Q9NRW7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS45Q9NRW7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS45Q9NRW7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS45Q9NRW7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS45Q9NRW7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS45Q9NRW7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS45Q9NRW7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS45Q9NRW7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS45Q9NRW7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS45Q9NRW7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS45Q9NRW7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS45Q9NRW7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS45Q9NRW7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS45Q9NRW7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS45Q9NRW7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS45Q9NRW7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS45Q9NRW7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
VPS45Q9NRW7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
VPS45Q9NRW7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS45Q9NRW7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS45Q9NRW7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS45Q9NRW7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS45Q9NRW7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS45Q9NRW7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS45Q9NRW7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS45Q9NRW7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS45Q9NRW7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS45Q9NRW7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS45Q9NRW7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS45Q9NRW7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS45Q9NRW7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS45Q9NRW7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS45Q9NRW7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS45Q9NRW7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS45Q9NRW7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS45Q9NRW7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS45Q9NRW7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS45Q9NRW7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS45Q9NRW7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS45Q9NRW7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS45Q9NRW7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS45Q9NRW7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS45Q9NRW7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS45Q9NRW7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS45Q9NRW7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS45Q9NRW7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS45Q9NRW7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VPS45Q9NRW7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VPS45Q9NRW7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VPS45Q9NRW7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VPS45Q9NRW7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS45Q9NRW7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS45Q9NRW7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS45Q9NRW7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS45Q9NRW7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS45Q9NRW7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VPS45Q9NRW7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VPS45Q9NRW7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VPS45Q9NRW7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VPS45Q9NRW7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VPS45Q9NRW7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VPS45Q9NRW7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VPS45Q9NRW7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VPS45Q9NRW7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VPS45Q9NRW7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VPS45Q9NRW7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VPS45Q9NRW7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
VPS45Q9NRW7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
VPS45Q9NRW7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS45Q9NRW7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS45Q9NRW7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS45Q9NRW7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS45Q9NRW7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS45Q9NRW7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS45Q9NRW7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS45Q9NRW7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS45Q9NRW7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS45Q9NRW7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS45Q9NRW7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS45Q9NRW7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS45Q9NRW7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS45Q9NRW7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS45Q9NRW7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS45Q9NRW7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS45Q9NRW7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS45Q9NRW7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS45Q9NRW7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS45Q9NRW7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS45Q9NRW7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS45Q9NRW7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS45Q9NRW7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS45Q9NRW7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS45Q9NRW7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS45Q9NRW7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS45Q9NRW7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS45Q9NRW7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS45Q9NRW7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS45Q9NRW7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS45Q9NRW7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms