Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR61

DLL4, Delta-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL4Q9NR61 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DLL4Q9NR61 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DLL4Q9NR61 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DLL4Q9NR61 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DLL4Q9NR61 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DLL4Q9NR61 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DLL4Q9NR61 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DLL4Q9NR61 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DLL4Q9NR61 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DLL4Q9NR61 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DLL4Q9NR61 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DLL4Q9NR61 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DLL4Q9NR61 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DLL4Q9NR61 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DLL4Q9NR61 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DLL4Q9NR61 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DLL4Q9NR61 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DLL4Q9NR61 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DLL4Q9NR61 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DLL4Q9NR61 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DLL4Q9NR61 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DLL4Q9NR61 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DLL4Q9NR61 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DLL4Q9NR61 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DLL4Q9NR61 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DLL4Q9NR61 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DLL4Q9NR61 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DLL4Q9NR61 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DLL4Q9NR61 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DLL4Q9NR61 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DLL4Q9NR61 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DLL4Q9NR61 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DLL4Q9NR61 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DLL4Q9NR61 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DLL4Q9NR61 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DLL4Q9NR61 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DLL4Q9NR61 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DLL4Q9NR61 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DLL4Q9NR61 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DLL4Q9NR61 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DLL4Q9NR61 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DLL4Q9NR61 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DLL4Q9NR61 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DLL4Q9NR61 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
DLL4Q9NR61 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DLL4Q9NR61 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DLL4Q9NR61 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DLL4Q9NR61 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DLL4Q9NR61 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DLL4Q9NR61 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DLL4Q9NR61 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DLL4Q9NR61 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DLL4Q9NR61 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DLL4Q9NR61 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DLL4Q9NR61 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DLL4Q9NR61 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DLL4Q9NR61 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DLL4Q9NR61 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DLL4Q9NR61 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DLL4Q9NR61 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DLL4Q9NR61 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DLL4Q9NR61 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DLL4Q9NR61 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DLL4Q9NR61 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DLL4Q9NR61 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DLL4Q9NR61 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DLL4Q9NR61 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DLL4Q9NR61 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DLL4Q9NR61 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DLL4Q9NR61 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DLL4Q9NR61 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DLL4Q9NR61 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DLL4Q9NR61 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DLL4Q9NR61 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DLL4Q9NR61 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DLL4Q9NR61 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DLL4Q9NR61 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DLL4Q9NR61 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DLL4Q9NR61 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DLL4Q9NR61 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DLL4Q9NR61 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DLL4Q9NR61 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DLL4Q9NR61 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DLL4Q9NR61 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DLL4Q9NR61 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DLL4Q9NR61 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DLL4Q9NR61 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DLL4Q9NR61 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DLL4Q9NR61 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DLL4Q9NR61 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DLL4Q9NR61 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DLL4Q9NR61 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DLL4Q9NR61 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DLL4Q9NR61 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DLL4Q9NR61 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DLL4Q9NR61 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DLL4Q9NR61 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DLL4Q9NR61 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DLL4Q9NR61 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DLL4Q9NR61 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms