Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PFDN4Q9NQP4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PFDN4Q9NQP4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PFDN4Q9NQP4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PFDN4Q9NQP4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PFDN4Q9NQP4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PFDN4Q9NQP4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PFDN4Q9NQP4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PFDN4Q9NQP4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PFDN4Q9NQP4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PFDN4Q9NQP4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PFDN4Q9NQP4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PFDN4Q9NQP4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PFDN4Q9NQP4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PFDN4Q9NQP4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PFDN4Q9NQP4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PFDN4Q9NQP4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PFDN4Q9NQP4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PFDN4Q9NQP4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PFDN4Q9NQP4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PFDN4Q9NQP4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PFDN4Q9NQP4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PFDN4Q9NQP4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PFDN4Q9NQP4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PFDN4Q9NQP4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PFDN4Q9NQP4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PFDN4Q9NQP4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PFDN4Q9NQP4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PFDN4Q9NQP4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PFDN4Q9NQP4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PFDN4Q9NQP4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PFDN4Q9NQP4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PFDN4Q9NQP4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PFDN4Q9NQP4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PFDN4Q9NQP4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PFDN4Q9NQP4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PFDN4Q9NQP4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PFDN4Q9NQP4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PFDN4Q9NQP4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PFDN4Q9NQP4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PFDN4Q9NQP4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PFDN4Q9NQP4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PFDN4Q9NQP4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PFDN4Q9NQP4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PFDN4Q9NQP4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PFDN4Q9NQP4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PFDN4Q9NQP4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PFDN4Q9NQP4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PFDN4Q9NQP4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PFDN4Q9NQP4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PFDN4Q9NQP4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PFDN4Q9NQP4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PFDN4Q9NQP4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PFDN4Q9NQP4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PFDN4Q9NQP4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PFDN4Q9NQP4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PFDN4Q9NQP4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PFDN4Q9NQP4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PFDN4Q9NQP4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PFDN4Q9NQP4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PFDN4Q9NQP4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PFDN4Q9NQP4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PFDN4Q9NQP4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PFDN4Q9NQP4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PFDN4Q9NQP4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PFDN4Q9NQP4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PFDN4Q9NQP4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PFDN4Q9NQP4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PFDN4Q9NQP4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PFDN4Q9NQP4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PFDN4Q9NQP4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PFDN4Q9NQP4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PFDN4Q9NQP4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PFDN4Q9NQP4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PFDN4Q9NQP4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PFDN4Q9NQP4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PFDN4Q9NQP4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PFDN4Q9NQP4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PFDN4Q9NQP4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PFDN4Q9NQP4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PFDN4Q9NQP4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PFDN4Q9NQP4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PFDN4Q9NQP4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PFDN4Q9NQP4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PFDN4Q9NQP4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PFDN4Q9NQP4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PFDN4Q9NQP4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PFDN4Q9NQP4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PFDN4Q9NQP4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PFDN4Q9NQP4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFDN4Q9NQP4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFDN4Q9NQP4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFDN4Q9NQP4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFDN4Q9NQP4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFDN4Q9NQP4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFDN4Q9NQP4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PFDN4Q9NQP4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PFDN4Q9NQP4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PFDN4Q9NQP4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PFDN4Q9NQP4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms