Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYLDQ9NQC7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYLDQ9NQC7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYLDQ9NQC7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYLDQ9NQC7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYLDQ9NQC7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYLDQ9NQC7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYLDQ9NQC7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYLDQ9NQC7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYLDQ9NQC7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYLDQ9NQC7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYLDQ9NQC7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CYLDQ9NQC7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CYLDQ9NQC7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CYLDQ9NQC7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CYLDQ9NQC7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CYLDQ9NQC7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CYLDQ9NQC7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CYLDQ9NQC7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CYLDQ9NQC7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CYLDQ9NQC7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CYLDQ9NQC7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CYLDQ9NQC7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CYLDQ9NQC7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CYLDQ9NQC7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CYLDQ9NQC7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CYLDQ9NQC7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CYLDQ9NQC7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CYLDQ9NQC7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CYLDQ9NQC7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CYLDQ9NQC7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CYLDQ9NQC7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CYLDQ9NQC7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CYLDQ9NQC7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CYLDQ9NQC7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CYLDQ9NQC7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CYLDQ9NQC7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CYLDQ9NQC7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CYLDQ9NQC7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CYLDQ9NQC7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CYLDQ9NQC7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CYLDQ9NQC7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CYLDQ9NQC7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CYLDQ9NQC7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CYLDQ9NQC7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CYLDQ9NQC7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYLDQ9NQC7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYLDQ9NQC7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYLDQ9NQC7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYLDQ9NQC7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYLDQ9NQC7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYLDQ9NQC7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYLDQ9NQC7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYLDQ9NQC7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYLDQ9NQC7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYLDQ9NQC7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYLDQ9NQC7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CYLDQ9NQC7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CYLDQ9NQC7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CYLDQ9NQC7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CYLDQ9NQC7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CYLDQ9NQC7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYLDQ9NQC7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYLDQ9NQC7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYLDQ9NQC7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYLDQ9NQC7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYLDQ9NQC7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CYLDQ9NQC7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CYLDQ9NQC7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYLDQ9NQC7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYLDQ9NQC7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CYLDQ9NQC7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CYLDQ9NQC7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CYLDQ9NQC7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CYLDQ9NQC7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CYLDQ9NQC7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CYLDQ9NQC7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CYLDQ9NQC7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CYLDQ9NQC7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYLDQ9NQC7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYLDQ9NQC7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYLDQ9NQC7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYLDQ9NQC7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYLDQ9NQC7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYLDQ9NQC7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYLDQ9NQC7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYLDQ9NQC7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYLDQ9NQC7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYLDQ9NQC7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYLDQ9NQC7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYLDQ9NQC7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYLDQ9NQC7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CYLDQ9NQC7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CYLDQ9NQC7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYLDQ9NQC7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYLDQ9NQC7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYLDQ9NQC7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYLDQ9NQC7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYLDQ9NQC7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYLDQ9NQC7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
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