Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ6

MED4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED4Q9NPJ6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MED4Q9NPJ6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MED4Q9NPJ6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MED4Q9NPJ6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MED4Q9NPJ6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MED4Q9NPJ6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MED4Q9NPJ6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MED4Q9NPJ6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MED4Q9NPJ6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MED4Q9NPJ6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MED4Q9NPJ6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MED4Q9NPJ6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MED4Q9NPJ6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MED4Q9NPJ6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MED4Q9NPJ6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MED4Q9NPJ6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MED4Q9NPJ6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MED4Q9NPJ6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MED4Q9NPJ6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MED4Q9NPJ6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MED4Q9NPJ6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MED4Q9NPJ6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MED4Q9NPJ6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MED4Q9NPJ6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MED4Q9NPJ6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MED4Q9NPJ6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MED4Q9NPJ6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MED4Q9NPJ6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MED4Q9NPJ6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MED4Q9NPJ6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MED4Q9NPJ6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MED4Q9NPJ6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MED4Q9NPJ6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MED4Q9NPJ6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MED4Q9NPJ6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MED4Q9NPJ6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MED4Q9NPJ6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MED4Q9NPJ6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MED4Q9NPJ6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MED4Q9NPJ6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MED4Q9NPJ6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MED4Q9NPJ6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MED4Q9NPJ6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MED4Q9NPJ6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MED4Q9NPJ6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MED4Q9NPJ6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MED4Q9NPJ6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MED4Q9NPJ6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MED4Q9NPJ6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MED4Q9NPJ6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MED4Q9NPJ6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MED4Q9NPJ6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MED4Q9NPJ6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MED4Q9NPJ6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MED4Q9NPJ6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MED4Q9NPJ6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MED4Q9NPJ6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MED4Q9NPJ6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MED4Q9NPJ6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MED4Q9NPJ6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MED4Q9NPJ6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MED4Q9NPJ6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MED4Q9NPJ6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MED4Q9NPJ6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MED4Q9NPJ6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MED4Q9NPJ6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MED4Q9NPJ6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MED4Q9NPJ6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MED4Q9NPJ6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MED4Q9NPJ6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MED4Q9NPJ6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MED4Q9NPJ6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MED4Q9NPJ6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MED4Q9NPJ6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MED4Q9NPJ6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MED4Q9NPJ6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MED4Q9NPJ6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MED4Q9NPJ6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MED4Q9NPJ6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MED4Q9NPJ6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MED4Q9NPJ6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MED4Q9NPJ6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MED4Q9NPJ6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MED4Q9NPJ6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MED4Q9NPJ6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MED4Q9NPJ6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MED4Q9NPJ6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MED4Q9NPJ6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MED4Q9NPJ6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MED4Q9NPJ6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MED4Q9NPJ6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MED4Q9NPJ6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MED4Q9NPJ6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MED4Q9NPJ6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MED4Q9NPJ6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MED4Q9NPJ6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MED4Q9NPJ6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MED4Q9NPJ6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MED4Q9NPJ6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MED4Q9NPJ6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms