Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU0

CD248, Endosialin, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD248Q9HCU0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CD248Q9HCU0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CD248Q9HCU0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CD248Q9HCU0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CD248Q9HCU0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CD248Q9HCU0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CD248Q9HCU0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CD248Q9HCU0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CD248Q9HCU0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CD248Q9HCU0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CD248Q9HCU0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CD248Q9HCU0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CD248Q9HCU0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CD248Q9HCU0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CD248Q9HCU0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CD248Q9HCU0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CD248Q9HCU0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CD248Q9HCU0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CD248Q9HCU0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CD248Q9HCU0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CD248Q9HCU0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CD248Q9HCU0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CD248Q9HCU0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CD248Q9HCU0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CD248Q9HCU0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CD248Q9HCU0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CD248Q9HCU0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CD248Q9HCU0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CD248Q9HCU0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CD248Q9HCU0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CD248Q9HCU0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CD248Q9HCU0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CD248Q9HCU0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CD248Q9HCU0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CD248Q9HCU0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CD248Q9HCU0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CD248Q9HCU0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CD248Q9HCU0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CD248Q9HCU0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CD248Q9HCU0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CD248Q9HCU0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CD248Q9HCU0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CD248Q9HCU0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CD248Q9HCU0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CD248Q9HCU0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CD248Q9HCU0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CD248Q9HCU0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CD248Q9HCU0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CD248Q9HCU0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CD248Q9HCU0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CD248Q9HCU0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CD248Q9HCU0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CD248Q9HCU0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CD248Q9HCU0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CD248Q9HCU0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CD248Q9HCU0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CD248Q9HCU0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CD248Q9HCU0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CD248Q9HCU0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CD248Q9HCU0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CD248Q9HCU0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CD248Q9HCU0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CD248Q9HCU0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CD248Q9HCU0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CD248Q9HCU0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CD248Q9HCU0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CD248Q9HCU0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CD248Q9HCU0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CD248Q9HCU0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CD248Q9HCU0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CD248Q9HCU0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CD248Q9HCU0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CD248Q9HCU0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CD248Q9HCU0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CD248Q9HCU0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CD248Q9HCU0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CD248Q9HCU0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CD248Q9HCU0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CD248Q9HCU0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD248Q9HCU0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD248Q9HCU0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD248Q9HCU0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CD248Q9HCU0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD248Q9HCU0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD248Q9HCU0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD248Q9HCU0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CD248Q9HCU0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CD248Q9HCU0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CD248Q9HCU0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CD248Q9HCU0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CD248Q9HCU0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CD248Q9HCU0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CD248Q9HCU0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD248Q9HCU0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD248Q9HCU0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD248Q9HCU0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CD248Q9HCU0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD248Q9HCU0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD248Q9HCU0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD248Q9HCU0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms