Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC96

CAPN10, Calpain-10, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN10Q9HC96 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN10Q9HC96 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN10Q9HC96 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN10Q9HC96 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN10Q9HC96 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN10Q9HC96 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN10Q9HC96 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN10Q9HC96 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN10Q9HC96 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN10Q9HC96 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN10Q9HC96 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN10Q9HC96 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN10Q9HC96 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN10Q9HC96 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN10Q9HC96 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN10Q9HC96 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN10Q9HC96 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN10Q9HC96 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN10Q9HC96 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN10Q9HC96 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN10Q9HC96 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN10Q9HC96 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN10Q9HC96 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN10Q9HC96 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN10Q9HC96 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN10Q9HC96 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN10Q9HC96 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN10Q9HC96 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN10Q9HC96 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN10Q9HC96 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN10Q9HC96 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN10Q9HC96 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN10Q9HC96 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN10Q9HC96 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN10Q9HC96 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN10Q9HC96 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN10Q9HC96 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN10Q9HC96 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN10Q9HC96 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CAPN10Q9HC96 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CAPN10Q9HC96 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN10Q9HC96 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN10Q9HC96 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN10Q9HC96 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN10Q9HC96 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN10Q9HC96 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN10Q9HC96 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN10Q9HC96 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN10Q9HC96 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN10Q9HC96 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN10Q9HC96 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN10Q9HC96 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN10Q9HC96 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN10Q9HC96 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN10Q9HC96 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN10Q9HC96 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN10Q9HC96 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN10Q9HC96 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN10Q9HC96 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN10Q9HC96 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN10Q9HC96 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN10Q9HC96 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN10Q9HC96 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN10Q9HC96 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN10Q9HC96 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN10Q9HC96 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN10Q9HC96 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN10Q9HC96 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN10Q9HC96 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN10Q9HC96 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN10Q9HC96 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN10Q9HC96 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN10Q9HC96 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN10Q9HC96 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN10Q9HC96 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN10Q9HC96 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN10Q9HC96 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN10Q9HC96 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN10Q9HC96 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN10Q9HC96 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN10Q9HC96 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN10Q9HC96 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN10Q9HC96 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN10Q9HC96 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN10Q9HC96 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN10Q9HC96 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN10Q9HC96 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN10Q9HC96 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN10Q9HC96 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN10Q9HC96 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN10Q9HC96 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPN10Q9HC96 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN10Q9HC96 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN10Q9HC96 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN10Q9HC96 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN10Q9HC96 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN10Q9HC96 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN10Q9HC96 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN10Q9HC96 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN10Q9HC96 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms