Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC24A3Q9HC58 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC24A3Q9HC58 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC24A3Q9HC58 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC24A3Q9HC58 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC24A3Q9HC58 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC24A3Q9HC58 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC24A3Q9HC58 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC24A3Q9HC58 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC24A3Q9HC58 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC24A3Q9HC58 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC24A3Q9HC58 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC24A3Q9HC58 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC24A3Q9HC58 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC24A3Q9HC58 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC24A3Q9HC58 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC24A3Q9HC58 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC24A3Q9HC58 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC24A3Q9HC58 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC24A3Q9HC58 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC24A3Q9HC58 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC24A3Q9HC58 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC24A3Q9HC58 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC24A3Q9HC58 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC24A3Q9HC58 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC24A3Q9HC58 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC24A3Q9HC58 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC24A3Q9HC58 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC24A3Q9HC58 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC24A3Q9HC58 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC24A3Q9HC58 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC24A3Q9HC58 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC24A3Q9HC58 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC24A3Q9HC58 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC24A3Q9HC58 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC24A3Q9HC58 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC24A3Q9HC58 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC24A3Q9HC58 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC24A3Q9HC58 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC24A3Q9HC58 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC24A3Q9HC58 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC24A3Q9HC58 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC24A3Q9HC58 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC24A3Q9HC58 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC24A3Q9HC58 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC24A3Q9HC58 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC24A3Q9HC58 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC24A3Q9HC58 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC24A3Q9HC58 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC24A3Q9HC58 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC24A3Q9HC58 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC24A3Q9HC58 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC24A3Q9HC58 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC24A3Q9HC58 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC24A3Q9HC58 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC24A3Q9HC58 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC24A3Q9HC58 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC24A3Q9HC58 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC24A3Q9HC58 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC24A3Q9HC58 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC24A3Q9HC58 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC24A3Q9HC58 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC24A3Q9HC58 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC24A3Q9HC58 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC24A3Q9HC58 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC24A3Q9HC58 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC24A3Q9HC58 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC24A3Q9HC58 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC24A3Q9HC58 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC24A3Q9HC58 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC24A3Q9HC58 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC24A3Q9HC58 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC24A3Q9HC58 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC24A3Q9HC58 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC24A3Q9HC58 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC24A3Q9HC58 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC24A3Q9HC58 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC24A3Q9HC58 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC24A3Q9HC58 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC24A3Q9HC58 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC24A3Q9HC58 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC24A3Q9HC58 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC24A3Q9HC58 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC24A3Q9HC58 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC24A3Q9HC58 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC24A3Q9HC58 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC24A3Q9HC58 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC24A3Q9HC58 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC24A3Q9HC58 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC24A3Q9HC58 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC24A3Q9HC58 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC24A3Q9HC58 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC24A3Q9HC58 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC24A3Q9HC58 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC24A3Q9HC58 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC24A3Q9HC58 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC24A3Q9HC58 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC24A3Q9HC58 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC24A3Q9HC58 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC24A3Q9HC58 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms