Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5V9

CXorf56, UPF0428 protein CXorf56, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf56Q9H5V9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXorf56Q9H5V9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXorf56Q9H5V9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CXorf56Q9H5V9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CXorf56Q9H5V9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CXorf56Q9H5V9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CXorf56Q9H5V9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CXorf56Q9H5V9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXorf56Q9H5V9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXorf56Q9H5V9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXorf56Q9H5V9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXorf56Q9H5V9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXorf56Q9H5V9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXorf56Q9H5V9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXorf56Q9H5V9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CXorf56Q9H5V9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CXorf56Q9H5V9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXorf56Q9H5V9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXorf56Q9H5V9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXorf56Q9H5V9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXorf56Q9H5V9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXorf56Q9H5V9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXorf56Q9H5V9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXorf56Q9H5V9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXorf56Q9H5V9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXorf56Q9H5V9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CXorf56Q9H5V9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXorf56Q9H5V9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXorf56Q9H5V9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXorf56Q9H5V9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXorf56Q9H5V9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CXorf56Q9H5V9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXorf56Q9H5V9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXorf56Q9H5V9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXorf56Q9H5V9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXorf56Q9H5V9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXorf56Q9H5V9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXorf56Q9H5V9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXorf56Q9H5V9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXorf56Q9H5V9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXorf56Q9H5V9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXorf56Q9H5V9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CXorf56Q9H5V9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CXorf56Q9H5V9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CXorf56Q9H5V9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXorf56Q9H5V9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXorf56Q9H5V9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXorf56Q9H5V9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXorf56Q9H5V9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXorf56Q9H5V9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXorf56Q9H5V9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXorf56Q9H5V9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXorf56Q9H5V9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXorf56Q9H5V9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXorf56Q9H5V9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXorf56Q9H5V9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXorf56Q9H5V9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXorf56Q9H5V9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXorf56Q9H5V9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXorf56Q9H5V9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXorf56Q9H5V9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXorf56Q9H5V9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXorf56Q9H5V9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXorf56Q9H5V9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXorf56Q9H5V9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CXorf56Q9H5V9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXorf56Q9H5V9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXorf56Q9H5V9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXorf56Q9H5V9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXorf56Q9H5V9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXorf56Q9H5V9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXorf56Q9H5V9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXorf56Q9H5V9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CXorf56Q9H5V9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXorf56Q9H5V9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXorf56Q9H5V9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXorf56Q9H5V9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXorf56Q9H5V9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXorf56Q9H5V9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXorf56Q9H5V9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXorf56Q9H5V9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXorf56Q9H5V9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXorf56Q9H5V9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXorf56Q9H5V9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXorf56Q9H5V9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXorf56Q9H5V9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXorf56Q9H5V9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXorf56Q9H5V9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CXorf56Q9H5V9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXorf56Q9H5V9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXorf56Q9H5V9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXorf56Q9H5V9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXorf56Q9H5V9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXorf56Q9H5V9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXorf56Q9H5V9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CXorf56Q9H5V9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXorf56Q9H5V9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXorf56Q9H5V9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXorf56Q9H5V9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXorf56Q9H5V9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms